十二日（丁未），湖广总督仍办台湾军务将军常青等奏：『南路贼首庄大田于附近各处纠众攻扰，官兵接战屡胜；凡被胁从贼之各庄民人俱请给腰牌归庄，臣等酌量发给。但贼匪尚在窥伺滋扰，若遽舍南趋北，恐近府贼窝又思窃发，而已经安业各庄不无惶惑；俟添调满洲、粤东官兵到营，再图进剿。又游击邱能成解押军装、火药前赴诸罗，现在鹿仔草被贼拦截，请兵接应；已派将弁带兵四百前往』。谕军机大臣等：『今日据常青奏到情形，则又似南路贼匪仍未溃散，尚在窥伺滋扰；而于贼匪乏食一节并未奏及，以掩饰其不即分兵往北之咎，是诚何心！常青、恒瑞同在府城营盘，一人统兵前往北路、一人留营驻守，有何可虑？岂得因贼匪牵制，并不挪移尺寸之地！若云保护村庄，则各处村庄甚多，即数万之兵亦不足敷零星分拨防守；岂又将增添大兵乎！贼匪围攻鹿仔草，游击邱能成请兵接应；常青等既知派兵四百接应，何不亲统大兵前往痛加剿杀，廓清路径？似此弁兵四百，岂能得力！且鹿仔草系僻小村庄，前后皆有贼匪；此四百官兵应需口粮从何接济？若再有挫失，咎将谁任？常青于此等事，何茫无主见若此！又蓝元枚处亦屡有旨令其统兵自北而南直抵诸罗，合兵会剿；乃亦未能前进。看来常青、蓝元枚总因持重怯懦，畏葸不前；常青不免蹈黄仕简覆辙，而蓝元枚迁延观望亦与任承恩相仿。伊二人受恩深重，如非黄仕简之老病颓废、任承恩之少不更事者可比；若再事因循，其获咎将甚于黄仕简、任承恩矣！现在浙、粤二省驻防绿营及续调漳州兵早已到齐，计此旨到时，节候又届深秋，暑气已减、雨水已稀；该将军惟当乘此兵力厚集，会合进剿。若俟福康安到彼一举蒇功，伊二人将置身何地耶！至南路被胁从贼之人俱请给腰牌归庄，该将军等即应妥为抚慰，设法招集；遵照前旨，或令入伍、或令归农，俾闻风投出，解散贼党，方为妥善』。
十五日（庚戌），谕曰：『魏大斌援应诸罗，而邱能成所押粮饷、火药仍被贼匪梗阻不能前进；看来竟系贼人狡计，将魏大斌放出重围听其入城，仍将粮饷截断，道路梗阻。则柴大纪虽与魏大斌会合，仍不能剿散贼匪；而诸罗添此应援之兵，粮饷又被截断，更恐军粮不给。着常青，李侍尧将所运诸罗粮饷、火药，究竟仍在鹿仔草或系全行运到？及鹿仔草道路曾否打通、不致梗阻之处？迅速驰奏。又据李侍尧奏：「徐鼎士禀称：令鹿仔港大兵密订进期，在大肚溪等处声援；而徐鼎士分兵两路，一攻大肚、一攻乌日庄，断贼左右。乌日一破，即以大炮轰击大里杙，使贼人腹背受敌；又可乘高而下，为捣穴擒渠之要策」。蓝元枚前已有旨令其统兵径赴诸罗，会合常青、柴大纪；今大甲一路既有可乘之机，该参赞又当与徐鼎士速行订期夹攻，直捣贼巢。用兵之道，原贵相机而动，不必拘泥前旨；着李侍尧、蓝元枚传谕徐鼎士：若能督率兵民乘机进剿，倾其巢穴，则逆匪伙党闻风解体，更无难迅速扫除扑灭；是平台之功，徐鼎士实为第一，将来受朕恩眷岂复可量耶！徐鼎士务须倍加努力，速成大功』。
——以上见「大清高宗纯皇帝实录」卷一千二百八十六。
十九日（甲寅），闽浙总督李侍尧覆奏：『恒瑞在军中，闻其诸事与常青和衷办理，并无意见不合；惟常青灭贼之心虽切，而军务素未历练，是以不能扼要制胜。可否于武臣中如海兰察者授为参赞大臣，令其前来会同常青督办军务？海兰察久历戎行，必能协力进剿；而常青处事亦极明白，自当坦怀商度，相与有成』。得旨：『已发往矣。恐常青管不住他，是求益而反损；已命福康安驰驿前往』。
二十日（乙卯），谕曰：『柴大纪处半月以来，总未据续有奏报。因思魏大斌应援之兵既已会合，柴大纪即不能进攻大里杙贼巢，自应令魏大斌分兵出城，将从前经过道路如鹿仔草一带屯聚贼匪先行剿散，廓清道路；纵使魏大斌不能分身，亦应于将弁中择其勇干可恃者，令其带兵出城剿捕。何以魏大斌到彼，柴大纪仍复漫无举动？岂添此魏大斌兵力徒令帮守县城，甘心受贼围困，而不思乘其新到锐气相机进剿耶！着传谕柴大纪应设法筹划，倍加奋勉』。
二十一日（丙辰），谕军机大臣曰：『魏大斌杀散贼匪、前抵诸罗，而一切军火粮饷仍不能运送入城，道路梗阻；是不惟柴大纪被围，而魏大斌又在贼围之中。常青等接到禀报，即应亲统大兵径赴诸罗，打通道路接应柴大纪，方可得力；乃仅添派蔡攀龙等带兵一千六百名前往援应。似此零星派拨，无益于事；不又似魏大斌乎！况柴大纪处被围日久，其势甚为急迫；常青于此时尚不亲往救援，岂拥此重兵徒以株守府城营盘为事耶！为今之计，常青处添调官兵早已齐集，竟应留恒瑞驻守府城营盘，常青统速大兵直抵诸罗。蓝元枚若已由大肚溪进兵，与徐鼎士订期夹击，固属甚善；否则，即直赴诸罗会合常青、柴大纪，则得二、三万大兵全力奋勇剿杀，进捣贼巢擒拏贼首贼目，庶可期迅速集事。至川省屯练降番，前已有旨派调二千人；该处兵丁自胜江西、广西远甚，是二千人足抵二万人之用，尤可资以杀贼。但屯练降番，到彼尚须时日；常青此时不可坐待，惟应就现在添调已到之兵迅速带往会合进剿，毋得再事因循，致蹈黄仕简等覆辙，自干重戾。福康安在途，当趱程前往；于抵厦门后，毋庸等候屯练兵到，竟先带同巴图鲁侍卫等星速前渡台湾，即统领该处官兵径赴诸罗会合常青、蓝元枚、柴大纪捣穴擒渠，痛加剿杀，以期迅奏肤功』。
二十二日（丁巳），谕军机大臣等：『昨据常青等奏「派兵接应诸罗」一折，反复思之，常青等办理此事，实属毫无定见，一筹莫展。既不能舍南趋北，又不分一人将南路之贼乘势歼除；岂在台湾坐守终老即能了事乎！常青何并未计及，止请于江西、广西添调官兵。试思江西、广西之兵与浙江之兵相等，岂能得力；而江西兵尤为绿营中之最无用者。若以此等无用之兵付伊等无用之人，徒以虚糜粮饷、轻试贼锋；而常青又于各处东派西拨，于事更属无益。从前黄仕简株守郡城，犹得借口兵少力单，不敷剿捕。今常青原带之兵已较黄仕简在彼时为多，又经陆续添调闽省及粤东、浙江绿营驻防兵，共计不下二万；兵力如此厚集，而复何所借口。常青可不勉图进取，稍续前愆耶！至福康安已有旨令其趱程行走，一抵厦门，竟当直赴诸罗会合蓝元枚、柴大纪等直捣贼巢，擒拏贼首贼目，以期迅速集事。常青究系年老，留于军营亦属无益；且军中有将军二人，恐事权不一，将弁无所禀承，转多未便。福康安到后察看情形，如有必须留彼帮办之处，即令常青于军营亦可；若留彼无用，即当令其来京陛见。至恒瑞年力精壮，应仍留于军营听候调遣。福康安带有「钦差关防」，即以钦差办理将军事务；其常青所带「福州将军印信」，仍着交与恒瑞可也』。
二十三日（戊午），谕军机大臣曰：『常青初到台湾，尚有振作之风；及不能取胜，又见贼多，竟致一筹莫展。此事惟仗福康安迅速到彼，督率筹办，以期壁垒一新，及早蒇事；若福康安亦如此恇怯，岂不失朕所望乎！总之，贼伙虽多，不过胁从乌合，易聚易散；止须将其渠魁擒戮，伙匪自必闻风瓦解。彼时相机酌办，或剿或抚，自无难迅速集事。若如常青零星派拨、分投堵御，徒使师老力疲，毫无寸进，转与贼人以暇，俾得肆其狡计；惟知奏请添兵，岂贼有二、三十万，亦将以二、三十万官兵应之，有是理乎！从前伊犁、金川等处皆系番回部落，其人岂止百万；大兵所临，无不摧破克捷，扫穴犁庭，悉就平定。况台湾本属内地，林爽文等不过么囗〈麻上骨下〉小丑乘间窃发；以如许兵力而贼首尚日久稽诛，更复成何事体耶！至李侍尧驻札厦门，闻见自必真切；乃并未将常青年老无用、办理竭蹶情形，据实陈奏。经朕降旨询问，尚以常青处事明白，可无庸另派更换。试思常青近日所办之事，尚能望其办理完结乎？看来李侍尧惟恐奏明常青于剿捕事宜不能得力，必派伊前往台湾接办，是以含糊其词，不肯直奏；此等处，亦不能逃朕洞鉴。其实李侍尧于地方军糈办理尚妥，而军旅素未娴习，石峰堡覆辙不远；即往台湾，与常青无异，朕亦断不派伊前往也。现在添调之兵计月内早已齐集，常青若能先将南路贼匪悉力歼除、贼目庄大田拏获，固可稍赎前愆；否则，速统大兵，乘其新到锐气直趋北路、前抵诸罗，亦尚可补过。若惟知株守郡城，坐视柴大纪被贼围困，致有疏虞，则是常青罪上加罪，恐不能当此重戾也。又，昨据常青奏：派令蔡攀龙等由海道前往诸罗援应；似由府城至诸罗之陆路已被贼人梗阻。现在发往柴大纪文报，究系于何路行走？而节次发给柴大纪谕旨，总未见覆奏；恐不免有在途遗失之事。若被贼人检得，贼众内不乏识字之人，转可得知官兵虚实，关系紧要。此后所发柴大纪文报，若由台湾府城赍递，即交常青专差奋勇弁兵递送；若由鹿仔港一路赍递，即交蓝元枚专差奋勇弁兵赍递，毋致稍有遗失迟误』。
二十四日（己未），钦差协办大学士陕甘总督办理将军事务福康安奏：『臣遵旨在途拆阅常青等奏折，知南、北两路官兵尚未得手；所称兵力不足，似属实在情形。现虽有添调之浙、粤官兵陆续配渡前往，但该兵丁等尚未出征，恐不能十分得力。至柴大纪力捍孤城，坐困已及两月；常青虽派蔡攀龙等带兵往援，而兵力无多，亦难实时进剿。若于郡城各营中拨兵援救，而贼人狡计百出，见大兵全集诸罗，又恐乘虚滋扰郡城。臣通盘筹划，所有前奉谕旨令贵州、湖北、湖南各挑备兵二千并四川屯练降番二千，恳饬各督、抚速拨赴闽，听候调用』。得旨：『即有旨谕；毋畏难、毋多虑，勉力行之，以全朕用人颜面』。
谕军机大臣等：『前因常青等办理剿捕事宜怯懦因循，茫无定见；是以特派福康安前往更换，督办军务。今阅奏到之折，看来福康安竟不免为常青所惑，略有畏难之意。现在常青处兵力虽经零星派拨，止存现兵四千名；但添调之浙粤驻防绿营兵五千名、又李侍尧于闽省泉州各营派拨兵三千名早应陆续到彼，加以川省屯练兵二千名昨已据鄂辉带领星速前往，是添调之兵不为不多。况福康安带领巴图鲁侍卫等百余人皆属屡经行阵，趫健可用；以如许兵力而又得奋勇带兵之人，更何必于此时先为鳃鳃过计乎！况就福康安所虑，如恐大兵往北，贼人乘虚滋扰郡城；试思贼匪等如由诸罗一路攻扰郡城，则贼人来路即福康安、常青等北去之路，正可迎头截杀，贼人焉能逼近郡城！若虑贼从间道山径潜出滋扰，我兵岂不可堵其出路。若虑南路之贼攻扰郡城，则常青在彼数月添兵未及到齐，尚能保守无虞；岂福康安与海兰察等同往，各路增调之兵万余又已到齐、且有巴图鲁侍卫等百余人，转虑其乘虚滋扰之理！即使常青于福康安未到之前业已带兵前赴北路，而郡城营盘尚有恒瑞带兵驻守，岂不足以捍御；福康安又何所顾虑而先存畏怯之意，甚不满朕所望矣！福康安身为统帅，军中俱视其意向；若先有示怯之意，则以下将弁等更必心存懦怯，士气岂能振奋耶！况即如请添调贵州、湖广等兵，亦必须两月之久方能到彼；设诸罗稍有意外之虞，已属缓不济急，于现在剿捕援应机宜有何裨益耶！福康安务须坚持定见，胸有成算，相机妥办；不可稍涉游移。总之，此事全在得其囗〈穴上疑下〉要，决机制胜，以期鼓勇直前。朕廑念军务，早已通盘筹划；今不妨为福康安明白宣示，使之安心。若此时常青等剿捕得有转机，早晚捷音奏至，即前此调备之黔、楚兵竟当停止征调，福康安自应速渡台湾督兵奋剿。万一常青等仍前株守，诸罗势竟不支，甚或至台湾全郡摇动，则其事必须大办；且将调用京兵及各省兵，并不止于调派贵州、湖广之兵而已。彼时自应令福康安驻札厦门，俟大兵齐集再图进取，必不令福康安止带屯练兵二千冒昧前进；何必于此时先存疑难畏怯之见乎！福康安接奉此旨，更当安心镇定，勉图克捷，毋负朕委任之意。再，现在台湾剿捕贼匪添兵甚多，将来进攻大里杙贼巢，尤须用炮轰击，火药、铅弹最关紧要；若运送军营时，或被贼人乘间邀截抢夺，贻误非细。着常青、李侍尧、蓝元枚等务须加派弁兵，小心押运，加意防范；倘稍有疏虞，惟伊等是问』。
