十七日（癸未），谕：『昨据柴大纪奏：将刘钦等三名正法示众；又有强取民物之兵丁陈恩成审明正法，衣物给还原主。所办俱属公当严明，已将该镇交部议叙矣。武职大员如或心存私见，于所属弁兵有需索不遂及挟嫌专戮情事，不但当革职治罪，即予以抵偿亦所应得。若行军之际，纪律贵在严明；绿营恶习最为可恶，平时则强取民物、临阵则恇怯退回，此而不诛，其何以昭军令而肃戎行！柴大纪深明纪律，将临阵退缩之弁兵立正典刑并将私取民家衣服之兵丁亦按军法从事，是以将弁兵丁共知儆惧，用命争先，得以屡次克捷；而郝壮猷驻守凤山，不惟不能如柴大纪之策励士卒抵御贼匪，且畏怯幸生、从而逃回，是以身伏刑诛。朕于军务从来信赏必罚，其奋勇出力者必从优甄录，而畏葸退缩者亦必重治示惩。国家累洽重熙，兵可百年不用，不可一日无备；前于甘省剿捕逆回蒇事后，曾命军机大臣会同该部将行军纪律择其紧要数条，颁发各营操演讲习，乃尚有郝壮猷等之畏葸偷生者。着将柴大纪用法严明、得邀奖叙，郝壮猷怯懦逃回、按律正法之处补行载入，通行训谕各营伍。俾专阃大员晓然于敌忾大义，共矢荩忱；而将备兵丁人人有勇知方，恪遵军纪，尽成劲旅：以副朕整饬戎行、谆切告诫之至意』。
二十日（丙戌），予福建因公出洋遭风淹毙之游击林朝绅、守备王泽浩、把总陈开桂、外委洪海、沈赞武、周明、黄正栋及兵丁陈闻等二十一名分别祭葬、荫恤如例。
二十四日（庚寅），湖广总督、仍办台湾军务将军常青奏：『台湾贼匪丑类众多，自府城十里之外村庄已被盘踞』；又署福建陆路提督柴大纪奏：『四月十六日，贼匪万余来攻诸罗』各情形。谕军机大臣等：『看来南路贼匪蜂屯蚁聚，势尚蔓延。常青发折时，只有粤兵四千名，于进剿事宜似不敷用。计此时恒瑞所带满兵一千名及李侍尧奏拨浙江兵一千名早抵台湾，兵力益厚，军威愈壮；常青、恒瑞亲督率前赴南路跟踪搜剿、廓清后路，并拣派得力将备于贼匪出没各要隘驻兵守御，防其绕出来犯凤山、郡城之路，最为紧要。至贼匪日积日多，蔓延滋扰，皆无藉贫民迫胁从贼；一将林爽文擒获，自必纷纷溃散。至乡勇、义民随同官兵昼夜防范、奋勇杀贼，实属可嘉！其阵亡受伤者，前经降旨照兵丁之例加倍恤赏。本日柴大纪折内有武举陈宗器、黄奠邦等率领义民，奋勇杀贼；此等武举、义民非弁兵可比，能打仗出力，更应格外优奖。着即查明将陈宗器等拔补千总等官，以示鼓励；其有奋勇出众者，即超擢守备亦无不可。并着常青一体查明义民向有实在出力者，必须迅速嘉奖，破格拔擢；庶伊等共知奖劝，用命争先，于剿捕更为得力。其署诸罗县知县陈良翼，堵御贼匪，甚属奋勉；即着实授』。
二十五日（辛卯），谕〔军机大臣等〕：『凡用兵以巴图鲁名号为荣；现在调集多兵剿办台湾逆匪，其节次奋勉出力人等即赏给巴图鲁名号，以示鼓励。着交常青将此旨通行晓谕，使众心益知踊跃。再，前此有如柴大纪之实在奋勉者，并确查二、三人，遇便奏闻赏给』。
二十七日（癸巳），谕：『据柴大纪奏：「四月二十一、二十三、二十七等日，贼首林爽文潜聚伙党分路侵扰诸罗县城，该总兵带领游击杨起麟、林光玉、邱能成，守备杨燝、署诸罗县陈良冀、武举陈宗器、黄奠邦等督率官兵义民出城迎捕截杀，争先奋勇、接仗数次，共鎗炮打死贼匪数百名、生擒正法者十余名，割获首级，夺获器械甚多。贼匪被官兵杀退，四散逃窜」等语。柴大纪自驻守诸罗以来，贼首纠合匪徒屡次攻扰，该总兵督率官兵、义民奋勇截杀，连得胜仗，贼匪败退；实属可嘉！柴大纪着交部议叙；其随从打仗出力之游击杨起麟、林光玉、邱能成、守备杨燝、陈明德、署诸罗县陈良翼、武举陈宗器、黄奠邦、贡监生张明义等，着交常青俟将来到彼时查明具奏，候朕降旨议叙奖擢』。
又谕曰：『常青自抵台湾，即慰抚义民、乡勇，俾伊等共知激劝、用命争先；至贼匪攻犯府城，豫先设法防堵，并督率官兵、乡勇迎捕截杀，屡次克捷，甚合机宜，朕心深为嘉奖。常青，着交部从优议叙。至李侍尧驻札厦门一带照料官兵配渡迅速及办理军需粮饷均能先事豫筹，源源接济；孙士毅挑备粤兵遄赴闽省，所有火药、铅弹等物均能宽裕筹备，解送应用：皆属急公可嘉。李侍尧、孙士毅亦着交部议叙』。
二十八日（甲午），谕军机大臣等：『现在台湾调往征兵，所有额缺，自应先于义民、乡勇内择其奋勇出力者拔补。至台湾曩时轮班驻守之戍兵，向例本由内地各营派往。朕思此等戍兵由内地调遣，既不免往返繁费；而该兵丁等一经调派戍守，更不免系念家室。若专用台湾本地民人充补，又恐日久，该处情形内地不能熟悉，亦非万全无弊之道。朕意嗣后此等换班兵丁，一半用该处土著、一半仍由内地各营抽调派往换班，则内地既可稍省调遣繁费、又能熟悉台湾风土人情，实为一举两得；且游手无藉之徒得以归伍食粮，更可化无用为有用。着常青、李侍尧于剿捕贼匪事竣后，公同熟商，遵照办理。又天地会名目，上年系林爽文倡起，由台湾而至内地。现据蓝元枚访知会匪多系漳属之平和、长泰等县人；是林爽文不但窥伺台湾，并欲勾结漳、泉一带蔓延滋扰，显有先得台湾、便可渐入内地之意，甚为奸险可恶。但此时不可遽行查办，以致人心惊扰。将来剿贼事竣后，常青、李侍尧务将结会根由及附从入教者详悉查明，痛加惩创；不可稍留余孽』。
二十九日（乙未），谕〔军机大臣等〕：『将来剿捕事竣，柴大纪屡着劳绩，自应即实授提督。但该镇任台湾总兵已经数年，该处情形较为熟悉；且领兵剿贼，屡次克捷，威望较着。即日贼匪荡平，所有善后事宜皆须该镇随同常青悉心筹办。而台湾经此次贼匪滋扰、官兵平定之后，尤宜加意整顿；若将柴大纪授为提督，则须驻札内地，台湾即无熟手经理之人。朕意将来事竣后，应令柴大纪以提督管台湾镇总兵事务，在彼弹压料理二、三年，再调回内地，于绥靖地方更为有益。所有内地提督员缺，着常青、李侍尧于梁朝桂、陆廷柱二人中察其才具并何人最为打仗出力之处，酌举一人可以署理提督者，据实具奏。至常泰现署提督，留驻漳州；虽未经领兵打仗，如量其才具堪胜提督之任，并着一并奏闻，候朕酌量简署。至台湾远隔重洋，屡有械斗抢夺之案；今林爽文等竟敢立会纠众、劫县杀官，自系历任道、府废弛阘冗、扰累地方，以致养廱敛怨，激成事端。不可不严加治罪，以儆将来。着传谕常青、李侍尧于剿贼事竣，即将历任道、府严切查明，据实参奏』。
三十日（丙申），谕〔军机大臣等〕：『朕披阅蓝鼎元所著「东征集」，系康熙年间台湾逆匪朱一贵滋事、官兵攻剿时，伊在其兄蓝廷珍幕中所论台湾形势及经理事宜，其言大有可采。如所称：「诸罗一县地方辽阔，鞭长莫及，应划虎尾溪以上另设一县，分驻半线地方；并于各要隘处所增添巡检、千把总员弁，以资防守」等语；后从其说，添彰化一县。至该处迄今又阅六十余年，土地日辟、户口日滋，酌量情形，有须添设文武员弁以资控制抚驭之处；前经降旨令常青、李侍尧于剿贼完竣办理善后事宜时，一并筹酌。今阅蓝鼎元即有此议，是台湾增设官弁，实为最要。又覆阅总督满保「经画疆理」一书，内称「台湾地方地土广饶，糖、榖之利甲天下；过此再四、五十年，即内山山后皆将为良田美产。若划定疆界，将人民驱逐，不许往来耕种，势难禁止」等语。所言亦属有理。台湾疆土既开，民安耕凿，处处皆成膏腴之地；自杨景素议立界限之后，界外良田美产转畀生番，而生番以射生为业、不事耕种，势必内地民人仍往偷垦，日久徒滋事端。又与提督施世骠书内称：「贼众至三十万，其中畏死胁从，非尽出于本愿，或有挂名贼党以保身家者；若尽诛之，多杀生灵，亦属无益。似应止歼巨魁，反侧皆令自新」等语。现在林爽文纠合匪众，所到村庄以势迫胁，如有不从者即行焚杀；小民畏死偷生，出于不得已，勉强附从：以致日积日多，前后自出一辙。朕于此事初起时即经降旨谕令该督等惟将渠魁首逆及实在党恶不法者歼戮无遗，其被贼迫胁听从者准其悔罪自新，以解散贼党；蓝鼎元之语，适与朕意相合。常青于整齐兵力进剿时，不妨先将此意出示晓谕，使被胁良民及从贼伙党得以畏罪投诚，亦解散贼党、先声夺人之一法。此外，书内所列各条尚多可采者。蓝鼎元籍隶漳浦，所著「东征集」，闽省通行者必多；着常青、李侍尧即行购取详阅，于办理善后时将该处情形细加察核；如其书内所论各条有与现在事宜确中利弊囗〈穴上疑下〉要者，不妨参酌采择，俾经理海疆事事悉归尽善，以为一劳永逸之计』。
——以上见「大清高宗纯皇帝实录」卷一千二百八十一。
六月初三日（己亥），谕曰：『庄锡舍自投诚后，屡次随同官兵打仗杀贼。兹闻庄大田带领番妇等屯聚南潭，即密行禀报并自带义民与官军内外应合，当将番妇及贼犯林红擒献；甚属出力可嘉。庄锡舍着即赏给守备；并着常青面加晓谕奖励，俾益知感奋，力图自效。阅贼首林爽文所给番妇札内有「到府城相会」之语；是其意实欲窥伺府城。特因大里杙是其巢穴，与诸罗相近；林爽文惟恐远离该处，为柴大纪所乘，是以尚在诸罗一带滋扰；而庄大田屯聚南潭等处，纠集伙党分踞要路，其意则专在府城。此时若能先将庄大田擒获，则南路贼匪自可以次廓清。现在常青于粤兵到齐后带领出城剿捕，即连得胜仗；已觉壁垒一新，声威壮盛。恒瑞所带驻防满兵及蓝元枚所带浙兵一得顺风，自可遄渡；常青于恒瑞等到后，即可会同统领大兵前赴南路逐一歼除，乘胜疾趋，捣穴擒渠，一举蒇事。再，朕披阅蓝鼎元所著「平台纪略」，蓝廷珍进攻鹿耳门、收复郡城不过七日，而其余党窜逃各处乘间窃发，辗转收捕，几及二年，始能办理完结。将来常青、蓝元枚南北两路进兵攻剿，擒获首逆林爽文、庄大田等，自应解京尽法处治；其被贼胁从、随同附和之村庄百姓，应先行晓谕，令其速行改悔、弃械归农，即贷其一死，各为安分良民，以解散其党羽。至贼目及天地会匪自知罪在不赦，一见首逆被擒，势必纷纷窜入内山，希图苟延残喘；及大兵彻后，又复勾结滋事，将来办理转为棘手。常青于攻剿时，务须严密围堵。如可设法招抚者，不妨权宜招致；并晓谕生番：如有窜入该境者实时缚献，赏以花红布匹。如此办理，俾贼匪余孽无所逃窜，庶可净绝根株』。
初八日（甲辰），谕军机大臣等：『阅台湾图内斗六门有溪河数道，俱系通海之路。大埔林、牛稠山一带现在俱有贼匪窜聚，斗六门久被贼踞，南北声息不通。经常青派令参将潘韬带兵一千名前往诸罗协剿，该参将因陆路贼多、不能前进，仍回至府城，由海道至诸罗；是沿海一带尚无贼匪。即日大兵进剿，四路夹攻，将斗六门、大武陇等处窜踞贼匪廓清扫除；设贼匪计穷势蹙，或偷觅小舟由斗六门至溪河逸出海口，洋面岛溆丛杂，易于窜匿，希图苟延残喘亦未可定，不可不豫行设法防备。着传谕常青等务拣派得力将备带领弁兵，于通海各溪河处严密防守；所有通内山各要隘，亦务遵节次谕旨派兵堵截，并将船只收藏，毋令近岸。如此四面防堵，水陆两路俱无虞乘间窜逸，庶可搜剿无遗』。
——以上见「大清高宗纯皇帝实录」卷一千二百八十二。
十六日（壬子），谕：『前经降旨将蓝元枚调补福建水师提督，其福建陆路提督员缺，令常青、李侍尧于柴大纪、普吉保、常泰三人内察看孰为出力并才具堪胜提督者保举一人，候朕简放。今观柴大纪自驻诸罗以来，屡次将贼败退，实属奋勉可嘉；柴大纪，着即补授福建陆路提督。但柴大纪任台湾总兵已经数年，于该处情形较为熟悉，将来剿贼完竣，所有善后事宜正须该提督随同常青悉心筹办；柴大纪着以陆路提督兼管台湾镇总兵事务，在彼弹压照料。俟军务告竣，候朕酌量可以调回内地时再行降旨。柴大纪未回任以前，所有福建陆路提督事务，着常泰暂行署理』。
十九日（乙卯），谕：『现在台湾剿捕贼匪林爽文等尚未完竣，办理军需、粮饷等事，该省官员恐不敷差委；着派伊辙布、德明额、李滉、李华国、袁秉义、成明即各由驿起程前赴闽省，交与常青、李侍尧酌量分派差遣委用』。
