二月，倭犯潮州之鮀浦，攻蓬州千户所，佥事万仲分部水陆兵马，东西哨攻之，临敌而哨兵皆溃，领哨千户魏岳、高洪俱死。
倭犯福州，巡抚阮鹗不能御，取库银数万两及改机数百匹、金花牙轿赂之，以新造大舟六艘，俾载而去。
四月，倭寇二十四艘约数千人，掠临海之三石镇，总督胡宗宪驱走之。
倭千余攻惠安，知县林咸率丁壮乘城御之，倭攻五昼夜，不克，丁壮死者数百人，倭亦颇有损失，乃引去。
倭攻福清，破之。执知县叶宗文，劫库狱，杀虏男妇千余，纵火焚官兵廨舍。举人陈见率家僮御贼，不克，与训导邬中涵同被执，骂贼而死。
五月，福建倭结ズ，自海口出港。参将尹凤督武举杨承业等，引舟师击之。冲沈贼舟七艘，斩首六十八级，生擒七人，余舟败遁。凤等复追至东洛外洋，及七礁、白大棕、衣大洋等处，斩首百有余级，生擒十有六人，铳伤及溺水死者甚众。福与之患，由是少熄。
惠安知县林咸，率兵攻倭于县境之鸭山，乘胜追夺，陷贼伏中，死之。
六月，倭寇分犯同安、长乐、漳泉诸处，攻福清、南安二县，破之。巡按御史樊献科以闻，上命趣巡抚王询赴任，集兵追剿，歼于海口。在漳、泉者，亦创残遁去。已而叙功，升参将黎鹏举职，充鸣事官。夺守巡官参政万衣，副使邵楩等俸，俱戴罪杀贼。下福清知县黄文宗、南安知县涂光裕于御史问。
七月，以浙江岑港海寇未平，诏夺总兵俞大猷、参将戚继光、把总刘英等职，期一月内荡平，如过限无功，各逮系至京问，并夺兵备副使陈元琦、曹金等俸。令总督胡宗宪督之剿贼，若失事者，连坐。初，胡宗宪遣还毛海峰诱降王直，及至直下狱，海峰遂绝，与倭目善妙等五百余人烧船登岸，列栅舟山，阻岑港而守。官军四面围之，虽颇有斩获，然海中数苦毒雾，贼凭高死斗，我军莫利登先，多陷没者。是时，新倭大主朝议，虑其先后并合，为害将大。屡下严旨，趣宗宪督诸将及时平贼。宗宪惧得罪，乃上疏，侈言陆战功，谓贼虽未殄，然可期月而待。于是科部极言其欺诞，并劾失事诸臣之罪，乃有是命。
十月，岑港倭移巢柯梅，总督胡宗宪屡督兵讨之，不能克。于是御史李瑚追劾宗宪私诱王直启衅。御史王本固、南京给事中刘尧诲，亦劾其老师纵寇滥叨功赏，请行追夺。尧诲又言：前淮扬之变，知府石茂华、刘崇文等，婴城自保，顾得援军之力，却贼冒赏。御史马斯臧，伪增功次，亦当并治。兵部覆，请切责宗宪，而令查盘科道罗嘉宾、庞尚鹏并勘斯臧等事。上曰：宗宪军务重寄，宜去与留，其令廷臣集议，母党护依违斯臧等，本兵既据拟赏矣，如何又勘其并议上。于是成国公朱希忠等、吏部尚书吴鹏等议言：宗宪功多，当切责留用，如部议斯臧等事，已前决，当置勿问，如上旨。上手答曰：妖贼王直，罪浮赃富，本宗宪用计诱获，人皆知者，小人嫉功，会彼奏上玄瑞，遂尔有言，朕览诸疏付之丞弼议，拟用存公论耳！是岂不分是非、不明功罪？宗宪其仍奋用心平贼，以副简眷。未几，宗宪疏辩言：王直为东南大患，节经兵部题奉，钦依先有购求之文，后有许降之议，臣仰豕庙算，不惜身家，百计以图之，兹幸擒获。言者乃诬臣为私诱，诋臣为专擅，又以今岁继来之寇，谓由臣擒直启衅致之，是将嫁无穷之祸于任事者之身。昔岁臣任巡按时，徐海、陈东、麻叶，已盘据松江，结巢柘林，攻城破邑者四年矣，王直党果何人？招致何人？启衅乎？矧直猾谲善战，久囗海上，昔年以孤舟驻泊列表，俞大猷时为参将，以福船五十艘攻围数月，竟尔逸去，以此观之，此非可以力胜、非可以常视之也！方直跳梁海洋，中外惊诧，以为猛兽毒蛇，不啻丘富臣君，辛积虑幸而获之。乃言者复以么魔视之。夫直诚么魔，与海上事无轻重也，不足为臣功已矣，而又安得为臣大罪耶？臣力竭智殚，怨多毁集，愿举力以除舟山余孽，退伏斧钺，惟圣明裁察。上复报曰：卿计获妖贼，人所皆晓，特以献瑞故不敢直指引军事以害卿，宜揭诚展布，以平余氛，不允辞。
