黄帝《素问》（王冰注）唐玄宗《开元广济方》《天宝单方图》唐德宗《贞元广利方》《太仓公方》宋太宗《太平圣惠方》《扁鹊方》（三卷）张仲景《金匮玉函方》《华佗方》（十卷）张仲景《伤寒论》（成无己注）《支太医方》张文仲《随身备急方》《徐文伯方》初虞世《古今录验方》《秦承祖方》王焘《外台秘要方》华佗《中藏经》姚和众《延龄至宝方》《范汪东阳方》孙真人《千金备急方》《孙真人食忌》孙真人《千金翼方》《孙真人枕中记》《席延赏方》孙真人《千金髓方》《叶天师枕中记》《箧中秘宝方》许孝宗《箧中方》钱氏《箧中方》刘禹锡《传信方》王绍颜《续传信方》《延年秘录》柳州《救三死方》李绛《兵部手集方》《御药院方》崔行功《纂要方》《刘涓子鬼遗方》《乘闲集效方》陈延之《短剧方》葛洪《肘后百一方》《服气精义方》谢士泰《删繁方》胡洽居士《百病方》《孙兆口诀》《梅师集验方》崔元亮《海上集验方》《深师香港脚论》（即梅师）姚僧坦《集验方》孙氏《集验方》孟诜《必效方》平尧卿《伤寒类要》《斗门方》韦宙《独行方》王 《伤寒身验方》《胜金方》文潞公《药准》周应《简要济众方》《塞上方》王兖《博济方》沈存中《灵苑方》《救急方》《张路大效方》崔知悌《劳瘵方》《近效方》陈 《经验方》陈氏《经验后方》《苏沈良方》（东坡、存中）《十全博救方》昝殷《食医心镜》《必用方》张杰《子母秘录》杨氏《产乳集验方》昝殷《产宝》《谭氏小儿方》《小儿宫气方》《万全方》《太清草木方》李翱《何首乌传》《普救方》《神仙服食方》嵩阳子《威灵仙传》《寒食散方》贾相公《牛经》贾诚《马经》以上八十四家，系旧本所引。《灵枢经》王冰《玄密》张杲《医说》《黄帝书》《褚氏遗书》李濂《医史》秦越人《难经》《圣济总录》刘氏《病机赋》皇甫谧《甲乙经》宋徽宗《圣济经》刘克用《药性赋》王叔和《脉经》张仲景《金匮要略》彭祖《服食经》巢元方《病原论》《神农食忌》《神仙服食经》宋侠《经心录》《魏武帝食制》李氏《食经》王执中《资生经》娄居中《食治通说》《饮膳正要》刘河间《原病式》《太清灵宝方》《玄明粉方》刘河间《宣明方》戴起宗《脉诀刊误》吴猛《服椒诀》许洪《本草指南》黄氏《本草权度》陆氏《证治本草》土宿真君《造化指南》《医余录》月池《人参传》（李言闻）胡演升《炼丹药秘诀》《名医录》月池《艾叶传》张子和《儒门事亲》张洁古《医学启源》《菖蒲传》《医鉴》（龚信）《活法机要》杨天惠《附子传》《洁古家珍》李东垣《医学发明》东垣《辨惑论》东垣《脾胃论》东垣《兰室秘藏》《东垣试效方》王海藏《医家大法》海藏《医垒元戎》海藏《此事难知》海藏《阴证发明》罗天益《卫生宝鉴》丹溪《格致余论》丹溪《局方发挥》卢和《丹溪纂要》《丹溪医案》杨 《丹溪心法》方广《丹溪心法附余》《丹溪活套》程充《丹溪心法》滑伯仁《撄宁心要》《惠民和剂局方》陈言《三因方》孙真人《千金月令方》严用和《济生方》王氏《易简方》（王硕）杨子建《万全护命方》继洪《澹寮方》《是斋指迷方》（王贶）杨士瀛《仁斋直指方》余居士《选奇方》黎居士《易简方》《杨氏家藏方》（杨 ）《济生拔萃方》（杜思敬）胡KT 《卫生易简方》朱端章《卫生家宝方》许学士《本事方》（许叔微）《鸡峰备急方》（张锐）孙用和《传家秘宝方》王隐君《养生主论》《真西山卫生歌》赵士衍《九龠卫生方》王方庆《岭南方》《岭南卫生方》初虞世《养生必用方》周定王《普济方》（一百七十卷）虞抟《医学正传》李仲南《永类钤方》周定王《袖珍方》傅滋《医学集成》萨谦斋《瑞竹堂经验方》王履《溯洄集》叶氏《医学统旨》万表《积善堂经验方》戴原礼《证治要诀》《医学纲目》《孙氏仁存堂经验方》戴原礼《金匮钩玄》《医学指南》《杨氏颐真堂经验方》刘纯《玉机微义》《医学切问》《陆氏积德堂经验方》刘纯《医经国小》王玺《医林集要》《德生堂经验方》仙《乾坤秘韫》饶氏《医林正宗》《法生堂经验方》仙《乾坤生意》周良采《医方选要》刘松石《保寿堂经验方》窥玄子《法天生意》杨拱《医方摘要》陈日华《经验方》梁氏《总要》《医方大成》王仲勉《经验方》吴球《活人心统》方贤《奇效良方》刘长春《经验方》吴球《诸证辨疑》阎孝忠《集效方》《禹讲师经验方》赵氏《儒医精要》孙天仁《集效方》戴古渝《经验方》《濒湖医案》《试效录验方》龚氏《经验方》《濒湖集简方》《经验济世方》《蔺氏经验方》杨起《简便方》孙一松《试效方》阮氏《经验方》《坦仙皆效方》董炳《集验方》赵氏《经验方》危氏《得效方》（危亦林）朱端章《集验方》杨氏《经验方》《居家必用方》《经验良方》唐瑶《经验方》邓笔峰《卫生杂兴》《救急易方》《张氏经验方》王英《杏林摘要》《急救良方》《龚氏经验方》白飞霞《韩氏医通》白飞霞《方外奇方》《徐氏家传方》《张三丰仙传方》温隐居《海上方》《郑氏家传方》《王氏奇方》《海上仙方》谈野翁《试验方》丘琼山《群书日抄》《海上名方》《包会应验方》何子元《群书续抄》《十便良方》《孟氏诜方》张氏《潜江切要》李楼《怪证奇方》《生生编》邵真人《青囊杂纂》夏子益《奇疾方》《摘玄方》赵宜真《济急仙方》《纂要奇方》《端效方》王永辅《惠济方》《奚囊备急方》史堪《指南方》王 《百一选方》仙《寿域神方》陈直《奉亲养老书》《世医通变要法》吴 《扶寿精方》李廷飞《三元延寿书》何大英《发明证治》王氏《医方捷径》《保庆集》《保生余录》《神医普救方》杨炎《南行方》彭用光《体仁汇编》《传信适用方》王氏《究源方》王节斋《明医杂着》《摄生妙用方》艾元英《如宜方》《济生秘览》《王氏手集》《萧静观方》《锦囊秘览》《唐仲举方》《杨尧辅方》《金匮名方》《严月轩方》《郑师甫方》《芝隐方》《通妙真人方》《三十六黄方》葛可久《十药神书》苏遒《玄感传尸论》《上清紫庭追劳方》朱肱《南阳活人书》韩祗和《伤寒书》庞安时《伤寒总病论》吴绶《伤寒蕴要》赵嗣真《伤寒论》成无己《伤寒明理论》刘河间《伤寒直格》陶华《伤寒六书》李知先《活人书括》陈自明《妇人良方》郭稽中《妇人方》熊氏《妇人良方补遗》胡氏《济阴方》《妇人明理论》《妇人千金家藏方》《便产须知》《二难宝鉴》《妇人经验方》钱乙《小儿直诀》刘 《幼幼新书》《幼科类萃》陈文中《小儿方》曾世荣《活幼心书》徐用宣《袖珍小儿方》张焕《小儿方》寇衡《全幼心鉴》演山《活幼口议》《阮氏小儿方》鲁伯嗣《婴童百问》《活幼全书》《郑氏小儿方》汤衡《婴孩宝书》《卫生总微论》（即《保幼大全》）《鲍氏小儿方》汤衡《婴孩妙诀》姚和众《童子秘诀》《全婴方》王日新《小儿方》《小儿宫气集》魏直《博爱心鉴》高武《痘疹管见》（又名《正宗》）李言闻《痘疹证治》《痘疹要诀》李实《痘疹渊源》闻人规《痘疹论》（八十一篇）张清川《痘疹便览》陈自明《外科精要》薛己《外科心法》《外科通玄论》齐德之《外科精义》薛己《外科发挥》薛己《外科经验方》杨清叟《外科秘传》李迅《痈疽方论》周文采《外科集验方》《眼科龙木论》《飞鸿集》倪维德《原机启微集》《明目经验方》《宣明眼科》《眼科针钩方》《咽喉口齿方》以上二百七十七家，时珍所引者。
引据古今经史百家书目
时珍曰∶自陶弘景、唐、宋以下所引用者，凡一百五十一家。时珍所引用者，除旧本外，凡四百四十家。
《易经注疏》（王弼）《诗经注疏》（孔颖达、毛苌）《尔雅注疏》（李巡、邢 、郭璞）《尚书注疏》（孔安国）《春秋左传注疏》（杜预）《孔子家语》《礼记注疏》（郑玄）《周礼注疏》张湛注《列子》郭象注《庄子》杨 注《荀子》《淮南子鸿烈解》《吕氏春秋》葛洪《抱朴子》《战国策》司马迁《史记》班固《汉书》范晔《后汉书》陈寿《三国志》王隐《晋书》沈约《宋书》萧显明《梁史》李延寿《北史》魏征《隋书》欧阳修《唐书》王 《轩辕本纪》《穆天子传》《秦穆公传》《蜀王本纪》《鲁定公传》《汉武故事》《汉武内传》《壶居士传》《崔魏公传》《李宝臣传》《何君谟传》《李孝伯传》《李司封传》《柳宗元传》《梁四公子记》《唐武后别传》《南岳魏夫人传》《三茅真君传》葛洪《神仙传》干宝《搜神记》《紫灵元君传》刘向《列仙传》徐铉《稽神录》《玄中记》《洞微志》郭宪《洞冥记》乐史《广异记》刘敬叔《异苑》王子年《拾遗记》《太平广记》吴均《续齐谐记》段成式《酉阳杂俎》《异术》王建平《典术》杜 《通典》《异类》何承天《纂文》张华《博物志》《魏略》东方朔《神异经》盛宏之《荆州记》郭璞注《山海经》何晏《九州记》宗懔《荆楚岁时记》《华山记》顾微《广州记》徐表《南州记》《嵩山记》裴渊《广州记》万震《南州异物志》《南蛮记》杨孚《异物志》房千里《南方异物志》《太原地志》刘恂《岭表录异》孟 《岭南异物志》《永嘉记》朱应《扶南记》张氏《燕吴行纪》《南城志》《五溪记》王氏《番禺记》《白泽图》轩辕述《宝藏论》青霞子《丹台录》《斗门经》独孤滔《丹房镜源》《东华真人煮石法》《房室图》《太清草木记》《神仙芝草经》《异鱼图》《太清石璧记》《灵芝瑞草经》狐刚子《粉图》《魏王花木志》《夏禹神仙经》《四时纂要》贾思勰（音叶）《齐民要术》《三洞要录》郭义恭《广志》汜胜之《种植书》《八帝圣化经》崔豹《古今注》丁谓《天香传》《八帝玄变经》陆玑《诗义疏》陆羽《茶经》《神仙感应篇》李畋《该闻录》张 《朝野佥载》《神仙秘旨》杨亿《谈苑》《开元天宝遗事》《修真秘旨》《宣政录》郑氏《明皇杂录》颖阳子《修真秘诀》《五行书》孙光宪《北梦琐言》《左慈秘诀》《广五行记》欧阳公《归田录》陶隐居《登真隐诀》《遁甲书》沈括《梦溪笔谈》《耳珠先生诀》《龙鱼河图》景焕《野人闲话》《韩终采药诗》王充《论衡》黄休复《茆亭客话》《金光明经》《颜氏家训》《范子计然》《宋齐丘化书》《楚辞》李善注《文选》《张协赋》《本事诗》《江淹集》《宋王微赞》《庾肩吾集》《陈子昂集》《陆龟蒙诗》梁简文帝《劝医文》以上一百五十一家，旧本所引者。
