1月：
16日，罢苏元春江南练兵职务，回任广西提督。
22日，命陈泽霖招募勇壮驻江北操练，编成武卫先锋右军。
24日，诏命以端郡王载漪之子溥俊为同治（穆宗载淳）之嗣子，封为皇子（大阿哥）；以崇绮值弘德殿教授皇子溥俊读书，命徐桐予以照料。此系西太后为废光绪所作安排。
同时将废光绪意宣示中外。两江总督刘坤一与各国公使均表示反对。上海绅商一千二百三十余人与拥护维新之民众十万人亦通电反对。后西太后被迫搁置废黜光绪之举。
29日，光绪下诏：朕（光绪帝）来年为三十寿辰，停朝贺、筵宴，止文武大吏来京祝寿。定本年庚子科为恩科乡试，次年辛丑科为恩科会试。其正科乡、会试，递推于辛丑年（1901年）、壬寅年（1902年）举行。
本月，孙中山与陈少白创办之《中国日报》在香港出版。
2月：
5日，朝廷命醇亲王载沣（奕之子，继父王位）于内廷行走；命侍讲宝丰值弘德殿；以光绪帝三十寿辰（5月23日为其生辰）停本年秋决。光绪谕内阁：开科取士，一依祖法旧章，不得好异喜新；稍涉背经离道，即予摈弃之。
8日，逮捕前曾上书，反对废光绪之知府经元善，将其治罪，并籍没其冢。
14日，朝廷下诏悬赏十万两大索康有为、梁启超，毁其所著之书，阅读其报章者，亦罪之。前数日铲平其祖坟。
18日，平定三之夷乱，增设巴塘等处土官各职。
19日，总理各国事务衙门与法国人订定广州湾租约，租期为九十九年。
2月：
19日，为严禁义和团活动，光绪特谕：据总理各国事务衙门奏请，严禁义和拳活动等语。命直隶、山东各督抚剀切出示晓谕，严行禁止。使百姓咸知私立会名，皆属违禁犯法，务宜革除恶习，勉为良民，倘仍有执迷不悟，复蹈故辙，即行从严惩办，勿稍宽纵。至于非教徒与教徒，同是清廷百姓，凡遇词讼案件，地方官务当秉公审断，但分曲直，不分民、教，不得稍有偏倚，以合乎朝廷一视同仁之至意。
上年，毓贤为山东巡抚时，对义和拳采取放任态度，将其改名“义和团”。及发生沂州教案，各国公使诉诸政府，毓贤被撤职，改任山西巡抚，仍上书清廷，反对镇压拳民。袁世凯接任山东巡抚后，对义和团采取残酷镇压手段。义和团遂转移于直隶，以仇教灭洋相号召，并拆铁路毁电线等，直隶总督裕禄，优礼之，义和团遂以“扶清灭洋”为旗帜，与清廷相协合。清廷仇洋派王公大臣载漪、刚毅等，更欲利用义和团打击洋人，因而义和团在京、津地区迅猛发展，本年春，山东义和团乾子团、坎子团，自鲁北转入直隶境，向天津发展，“京畿东南各属，一唱百和，从者如归，城市乡村，遍设神坛，坛旁，刀戟林立”。京、津、保三角地带，成为义和团活动中心地区。靖海县有张德成、曹福田两支义和团劲旅，共有团民数万人。清廷已无力镇压。
3月：
2日，各国公使要求清廷下达剿办义和拳谕旨。
5日，黄河决口山东省滨州。
9日，各国公使夫人于仪銮殿觐见皇太后。
21日，订立中德胶济铁路章程，由华德商人合修胶济铁路。
26日，与墨西哥订定商约。
4月：
5日，命李盛铎为贺德国皇太子联姻专使；命吕海寰为贺德国皇太子加冕专使。
9日，滨州决口合龙。
10日，清廷以天旱不雨，诏中外详审并关注囚犯。
11日，赏高赓恩四品京堂，值弘德殿。
14日，命内阁学士桂春充出使俄国大臣，旋命兼出使奥地利国。
16日，甘肃靖远夷就抚，设置夷土官。
19日，命袁世凯汰疲去冗编成新兵二十营，增立一军，为武卫右军先锋队，总统由袁世凯兼任。
本月，梁启超致函孙中山，提议选举光绪帝为大总统。
清廷拨部银十万两赈山东、贵州等地灾区。
5月：
12日，罢善联船政职务，以许应骙兼船政大臣。
17日，义和拳入京师。
20日，各国驻华公使之首席代表西班牙驻华公使葛络干，在法国驻华公使毕盛请求下，召集驻京公使团会议，英、美、俄、法、德、意、奥、西、葡、比、日十一国使节，全部出席。毕盛和德国公使克林德主张立即联合出兵中国，对义和团进行镇压；英国公使窦纳乐反对立即派军入华，主张暂缓。会议最后决定：向中国政府提出照会六条：（一）严禁义和团的一切活动。（二）凡同情、支持和参与策划义和团活动者，均作义和团论处。（三）对镇压义和团不力之官员均加惩处。（四）对企图杀人放火、谋财害命之首恶均予处决。（五）凡在目前帮助、指导义和团者。均予处决。（六）于北京、直隶公布以上措施。拟定此照会后，又议决：如果五天之内未得圆满答复，“骚乱”仍旧继续，便组织一次海军示威。
21日，葛络干将此照会送交清廷总理各国事务衙门。
24日，实授李鸿章为两广总督。同日，总理衙门奏称：拳会造言煽惑，人心浮动，易肇事端，请谕令所司妥议防范章程。
26日，总理衙门答称（答外交使团）：正奏请发布严厉镇压义和团上谕，所采取措施，与外交使团所提相同。
27日，庆亲王奕勖和总理大臣崇礼接见各国驻京公使，表示对义和团坚决镇压，并亲自承担保护外国人之责任。各国公使继续等待。
28日，晚，各国公使会议，共同决定致电本国政府要求派兵来华，并照会中国政府。
29日，各外国军舰驶抵大沽口，其陆战队准备进攻天津、北京。
30日，午，停泊大沽口外之各国军舰共十二只。
29日，清廷谕内阁：近来京畿一带，乡民练习拳勇，良莠错出，深恐别滋事端，叠经谕令京外各衙门，严行禁止。近闻拳民中，多有游勇会匪，混迹其间，藉端肆扰，甚至戕杀官员，烧毁电杆、铁路。似此顽不畏法，其与乱民何异。着派出之统兵大员，及地方文武，迅即严拿首要，解散胁从，倘敢列仗抗拒，应即相继剿办。现在人心动摇，遇事生风，凡有教堂、教民地方，均应实力保护，俾获安全，而弭祸变。同日（29日）美国首先由霍尔上校、迈猷上校分别率陆战队五十二名，由大沽口乘船向天津进发，下午10时30分抵达。此时天津已有数月前抵达之英国陆战队二十五名。同日，各国驻京外交使团照会直隶总督裕禄：各国抽调士兵百名入京。清廷不予同意。
30日，英国派陆战队一百五十名抵达天津。
31日，清廷在各国公使威逼下同意各国派兵入京，但各国应以三十名为限，并且一旦事平，即行撤回。同日下午7时许，各国军队（“使馆卫队”）开始乘火车入京。英军七十五名、美军六十三名、意军四十二名、日军二十六名、法军七十五名、俄军七十五名，总计三百五十六名。德军五十名，于6月1日抵京；奥、匈军队于3日抵京；6月6日，日军增三十名人京。至6月8日，各国进京军队共近千人，是为八国联军之先头部队。
30日，拳民毁琉璃河、长辛店车站。朝廷命聂士成保护铁路。
本月，拳民毁保定铁路，副将杨福同前往镇压，行至涞水被杀。
6月：
2日，聚集渤海湾之外国军舰共二十五艘：英、德、日各三艘；美、法、意各二艘；俄国九艘；奥匈帝国一艘。集中大沽口之各国军队，亦急速增加，至本月中旬，已达二千多人。
3日，清廷命荣禄：“拳民虽良莠不齐，究系朝廷赤子……该大学士不得孟浪从事，率行派队剿办，激成变端，是为至要”。
6月5日，以后，在军机大臣刚毅默许下，义和团不断进入北京，刚毅等还于家中设坛拜拳，西太后亦于宫中设香案祀之。
9日，晚，西太后于皇宫召开御前会议，议定：“决计不将义和团剿除。因该团实皆忠心于国之人，如与以上等军械，好为操演，即可成为有用劲旅，以之抵御洋人，颇为有用”。对此，徐桐、刚毅等大员均表示积极支持。当时持异议者为荣禄、世铎（礼亲王、军机大臣）。此时满人亦多加入义和团，直隶境内团民不下二十万人，清廷已欲剿无力，只得顺应招抚之。同日晚8时许，英国公使窦纳乐获得西太后于御前会议决定驱逐外国军队之可靠消息。8时30分，窦即向英国驻天津领事贾礼士发出急电，让他通知高级海军军官，派部队登陆，为进军北京作好一切安排。窦同时又发一电给在大沽口之西摩尔中将（英国）。俄国公使亦于同日发电俄政府，要求派军侵华。法国驻津领事杜士兰于家中召开各国驻津领事和各国陆战队指挥官紧急会议。英、美、日、意、奥各国陆战队指挥官均同意急速派兵入京，但俄国人拒绝出兵。正在纷争之时，窦纳乐的告急电又至。贾礼士当场宣读：“情况万分危急，若再不准备火速进发北京，那就太迟了。”会议当即决定第二天（10日）即派联军人京，由西摩尔中将任联军统帅，美国麦卡加拉上校任副统帅，并要直隶总督裕禄为其准备火车。
10日，凌晨（三、四点钟），各国陆战队在塘沽登陆，欲从塘沽乘火车。裕禄以无朝廷旨意，不为备车。英国和德国人便抢占机车，以自己司机开车。9时30分，西摩尔率五百名联军乘第一列专车冲往北京；上午11时，德英日法俄联军乘第二列专车。本日共开出三列火车，运联军二千零五十三名。（亦谓二千零六十四人）此后一、二天内陆续有增加，总计不超过二千三百人。西摩尔以为很快即到北京，未多带粮饭与子弹。联军于中午抵杨村，顺利通过。继于11日抵落垡。但车轨被拆，联军开始边修铁路，边前进。
12日，傍晚，始抵廊坊车站，此处是天津至北京中分点，德国人于此修一格菲昂炮台。廊坊以下，铁路破坏严重，联军只好停车，开始大修铁路。
14日，正当联军贮水修路前进之时，义和团三百人向联军发起攻击。联军措手不及，即仓阜逃入车站。义和团手持长矛大刀跟踪而至，正当此时，一队美国兵开米，即以大炮轰击义和团，义和团伤亡惨重，即转身冲向美军，附近村庄义和团众，亦赶来助战，将侵略军围困于廊坊车站，奋战两昼夜，在敌人机枪扫射下，前仆后继，视死如归，敌人亦不得不称赞中国人之勇敢与爱国赤心。《惠泰尔日记》云：“面对着来福枪和机关枪秋风扫落叶似的射击，还是勇猛冲锋，真是不能想象世界上还有比他们更勇敢的人了。”义和团于本日，把西摩尔联军的后路切断。下午，义和团数百人，向落垡车站进攻，此处三十名英军，急向西摩尔求援，西摩尔即率部回救落垡，待落垡义和团撤退，联军仍幻想修路北犯。
15日，义和团又将落垡围困。
16日，西摩尔分军两路：一路留守廊坊，一队由西摩尔率领，回落垡固守，准备万不得已时，于杨村沿水路犯京。
此前。11日，董福祥军杀日本使馆书记生杉山彬于永定门外。（该日本书记生未遵中国戒严令，态度蛮横，中国士兵气愤之下将其杀死。）董军于京城焚烧教堂和街市，前门与前门外地区延烧四千余家。
13日，西太后谕裕禄：命其“迅将聂士成一军全数调回天津附近铁路地方扼要驻扎……如有外兵闯入畿辅（近京地带），定惟裕禄、聂士成、罗荣光是问”。本日，俄军开炮轰击赴天津火车站之义和团，义和团死伤惨重，怒而进攻天津租界。本日至15日，三天中，清廷仍继续公开下达镇压和解散义和团谕旨多次。
15日，下午，北京义和团攻击西什库教堂。同日拳民于京师五城坊市活动，发生流血事件。清廷命神机、虎神营，武卫中军巡街分驻九门，监管城门开、闭；令李鸿章、袁世凯入卫京师。
16日，西太后再开御前会议，光绪在场，反对用团民肉体对洋枪搏战，但只诘责臣下未能弹压拳民，未及其他。西太后则曰：“法术不足恃，岂人心亦不得恃乎？今日中国积弱已深，所仗者人心耳，若并人心而失之，何以立国？”决心利用义和团对洋人开仗。决定二项：（一）对义和团开一面之网，勒令解散，其有力精壮者可招募为军，免其生事。（二）义和拳民化莠为良有无把握，派世铎等细加体察，谋定而后动，万不可孟浪从事。同日谕内阁，命荣禄速派武卫中军加强保护东交民巷使馆区。在公开上谕中，清廷仍称义和团为拳匪。同时，经过讨论，议定对联军开战。
同日又谕：
“现在各国使馆，已饬荣禄派武卫中军等，认真保护，明降谕旨矣。此后各国如有续到之兵。仍欲来京，应即力为阻止，以符张冀等与杜士兰约定原议。如各国不肯践言，则衅自彼开，该督等须相机行事，朝廷不为遥制。万勿任令长驱直入，贻误大局，是为至要。”
同日，命李瑞遇、王懿荣为京师团练大臣；李秉衡、马玉昆领兵来京。当日晚，拳民烧正阳门城楼。清廷又命刚毅、董福祥募拳民精壮者编组成军，余者遣散。
17日，清廷命各省调兵入卫京师；外国联军攻击大沽口，提督罗荣光败走天津，死之，大沽口陷落。直隶总督却以捷报奏闻。清廷发内库银十万两，犒赏各军。
本日，义和团火烧天津各教堂；联军一百七十余人攻击天津武备学堂学生，学生均奋起反抗，英勇不屈。联军即放火焚烧武备学堂，学生大部分被烧死。天津清军立即往援，见学生尸体枕藉，并在烈火中燃烧，愤激异常，即对天津租界区——紫竹林展开猛攻。此时天津中国驻军为聂士成武卫前军，共七千人左右，前来之义和团有三万人。联军欲夺取天津，作为根据地，进一步攻占北京。但必先解租界之围，使大沽、老龙头车站、紫竹林联成一气，然后从海上增兵，进而夺取天津城。直隶总督裕禄则决定消灭租界敌人，保住天津城，然后进而收复大沽口。双方展开激战。至本月28日联军在大沽口登陆之兵已有一万四千五百人。
18日，西摩尔联军至附近村庄抢掠食物，空手而归。董福祥甘军与义和团对之联合攻击，骑兵在前，步兵在后，迅速逼近廊坊车站，但迎面遭到俄军之排枪射击。马队改绕小村向右侧攻击德国军队。步兵与义和团对联军战斗两小时，联军伤亡五十四人；清军和义和团伤亡几百人（法国人估计为四百人）。下午1时，战斗结束。同日，清廷谕军机大臣等，委主战派徐桐、崇绮、奕助、载漪与军机大臣会军商务。
19日，清廷命许景澄、那桐往告各国公使，迅速出京。至本日，西太后连召各王、大臣会商时局对策，载漪主对外开战态度甚坚；载勋、载濂、载澜、徐桐、崇绮又均附和之；荣禄则依违其间，全无定见。许景澄、袁昶，则反对对外开战，认为对拳民应当剿办。
同日，凌晨4时，西摩尔联军见中国军队加入战斗，前进已无希望，开始从杨村向天津回撤。此时白河桥已经破坏，西摩尔联军已不能乘火车退去，便将辎重、伤员置于九只木船，由北运河向天津撤退，各国军队，则沿运河步行，沿途不断受到义和团和清军的攻击，状极狼狈。晨六时，殿后部队亦撤走。22日，撤至西沽，即被围困，不得突围。24日，联军得一名清军士兵，为其密往天津送信。25日晨4时许，天津紫竹林租界组成一支救援部队，共二千五百余人，以俄军为主，出发增援。7时许，抵达西沽地区，西摩尔联军解围后，即将西沽军库焚毁（价值几百刀兀），于26日晨2时许（亦云三时许），向天津撤退，上午11时半，撤回天津租界。联军此次入侵行动，共死亡六十二人，伤二百二十八人。亦云伤者二百三十八人或三百十二人。
本日（19日）西太后接到列强所发出之最后通牒：限令21日晨2时，交出大沽口炮台。清总理衙门奉命照会各国公使，愿将各国驻京公使与其家眷于24小时内护送至天津。本日晚，各国公使联名复函清总署，要求展期护送赴津，并限于次日晨9时答复。20日，总署回复，说明展缓尚可通融，惟北京“团匪塞满街市”，各国公使不可来总署。但德国公使克林德盛气凌人，不听劝阻，单独带秘书柯达士径往总署抗议。当其行至东单牌楼时，正值神机营霆字枪队恩海率队巡逻，见洋人乘轿而来，即令其停止前进，并以枪指之，而克林德则首先发枪射击，恩海让过一弹，旋即反击一枪，击毙克林德。此消息传人东交民巷后，各国“使馆卫队”纷纷开出挑衅，并拒绝出京。当日下午，西太后令义和团和清军，联合攻打东交民巷使馆区。义和团伤亡惨重。
21日，大沽炮台失守。清廷下宣战诏书：中外衅起，准备作战；罢免原步军统领崇礼职，以载勋接替之；发仓米，开济拳民之食；继之，载漪命烧顺治门法国教堂；甘勇纵火烧翰林院，借以延烧使馆，西太后立于宫中高石之上观之。
26日，刘坤一、张之洞、李鸿章向上海各国领事提出《中外互保章程》，未随朝廷行动，单独对列强媾和。刘坤一（1830～1901），湖南新宁人。曾随湘军将领刘长佑对太平军作战。1874年出任两广总督，次年转任两江总督兼南洋通商大臣，与李鸿章等共同办理洋务。1894年，光绪二十年，中日之战爆发，奉调节制关内外清陆军，但徒拥虚名，毫无作为。次年回任两江总督。
27日，谕顺天府，五城平粜，收葬暴尸教民。
29日，命仓场侍郎刘恩溥赴天津招募身强者成军，与通州、武清、东安团民驻直隶省，并济之饷械。发仓米于通州开粜。
7月：
1日，清政府命各省保护教士、教民；拳民自首者允许自新。
5日，南漕运输受阻，命于清江浦置局采实（粮食）运京。
8日，西太后任命李鸿章为直隶总督兼北洋大臣，促其兼程来京，准备求和。
11日，外国联军攻击天津，聂士成战于八里台（庄），阵亡。
13日，京津地区战火正炽，中美《粤汉铁路借款续约》在华盛顿签字。前在1897年清政府同比利时洽谈卢汉铁路借款时，湘、鄂、粤三省绅商倡议自己集股兴建粤汉铁路，并呈请设立湘粤铁路公司总理其事；但湖广总督张之洞和盛宣怀，则主张借美国款项修造粤汉铁路，经奏准向美国借款后，盛宣怀立即通知驻美公使伍廷芳与美国合兴公司草签《粤汉铁路借款合同》，该合同规定借美款四百万镑，年息五厘，九折，以铁路资财作保，三十年还清，借款期间，铁路由合兴公司修造和经营；如与比国之卢汉铁路合同作废，该路亦归合兴公司承建；如清政府在路旁采煤，由合兴公司勘查开办。1899年3月，美国合兴公司代表来华签订正约，又附上铁路附近开矿章程，提出于韶州、衡州、郴州等地开矿要求，鄂湘粤三省人士，对此强烈反对，但因美国公使康格亲自出面施压，清政府遂同意此项开矿要求，于是日签订《粤汉铁路借款续约》。该约规定：借款金额增至四千万美元；美国合兴公司同时承建萍乡、岳州、湘潭支线；粤汉铁路与支线所过之处，不准修建与该干线、支线相平行之铁路，意欲独占该干线、支线之经营权。
14日，裕禄、宋庆、马玉昆均退守北仓。天津陷落。西太后即派荣禄向使馆求和，但使馆不予理会。
17日，清廷下诏缉捕杀德国公使“凶手”。
23日，西太后电催李鸿章来京。半个月后，任命李为议和全权大臣。
26日，命李秉衡帮办武卫军事，张春发、陈泽霖、万本华、夏辛西诸军，均听节制。
唐才常于上海张园召集会议，举容闳、严复为自立会正副会长，参加会议者有容闳、严复、章炳麟、文廷式、吴葆初、叶浩吾、宋恕、沈荩、龙泽原等八十余人，以叶浩吾为主席。开会宗旨为：一）不承认通匪（义和团）矫诏之伪政府。（二）联合外交。（三）平内乱。（四）保全中国自主。（五）推广支那未来之文明进化。唐才常为自立会总干事。容闳并起草英文宣言：决不承认满洲政府有统治清国之权。旋成立自立军。容闳（1828～1912），广东香山县人，孙中山同乡。留学美国耶鲁大学。曾受曾国藩委派赴美购买机器，于上海创办江南制造局。后历任中国留美学生监督、驻美公使。1894年中日战争中，主张以台湾作抵押，借外债四亿美元，加强对日作战力量。于上海张园会议后被通缉。1902年李纪堂发动洪全福起义，准备拥他为大总统。著作有《西学东渐记》。
唐才常（1867～1900），湖南省浏阳人。贡生出身。1897年与谭嗣同共办长沙时务学堂，编辑《湘学报》；并通过秦力山、林圭联络长江沿岸会党，为维新激进派，戊戌政变后逃亡日本。1899年与兴中会毕永年合作，准备联络会党起义，复于上海组正气会。
27日，各国联军于天津召开军事会议。
28日，西太后又杀吏部侍郎许景澄、太常寺卿袁昶，决心对列强作战。
30日，八国联军于天津成立“天津都统衙门”，衙门内之机构为：秘书处、巡捕局、库务、政府及私人无主财产管理部、军事部、司法部、粮食供应部等，形同军管机构。此时天津有联军一万四千六百四十人，海军二千四百九十人。
8月：
2日，朝廷命荣禄率军护卫各国公使往天津。
月初，各国联军举行第三次军事会议。决定4日下午3时，从天津出发，进犯北京。联军人数如下：日军八千人；俄军四千八百人；英军三千人；美军二千一百人；法军八百人；奥军五十八人；意军五十三人。（德国军队未赶到。）总计近二万人。
5日，夜，联军抵达北仓，分三路进攻北仓，经六小时激战，清军退出北仓，撤至杨村。
6日，联军复三面攻击杨村，杨村守军未作抵抗，纷纷撤退。宋庆、马玉昆闻风丧胆，只知溃退。裕禄见事不可为，拔枪自杀殉节。
8日，李秉衡与联军战于蔡村，败北，联军侵占河西坞。
11日，李秉衡再败于张家湾（今京郊通州境），阵亡。八国联军于12日，不战而人通州。
13日，联军向北京进犯。北京守军为董福祥之武卫后军三万人。
11日，以“里通外国”及妄言离间罪名将户部尚书立山、兵部尚书徐用仪、内阁学士联元论斩。
12日，命刚毅帮办武卫军事。
14日，晨，联军进抵北京齐化门，遭到清守军激烈抵抗，日、俄军不能临近城门；英、美军自广渠门冲入，占领天坛，下午3时，进入使馆区。
同日，西太后偕光绪帝仓皇逃亡，出北京德胜门奔向太原。出走前，西太后命将光绪帝之珍妃投入井中淹死，谓之赐死。北京陷落。当日晚，俄、日军由东直门进入使馆区。16日晚，联军经激烈战斗占领皇宫，清守军全撤。当日晨7时15分，联军发动解救北堂战斗，10时30分进入北堂（教堂），与义和团进行街垒战。义和团阵亡约六百余人，联军死伤二十余人。
清军此次抗战，完全惨败。西方民主政治下侵略军的枪炮，打败了东方专制者之军队，扫尽东方君主的威风。自此之后，推翻清政府的呼声，响遍全国各地；清朝江山，已日薄西山。
15日，法国派军三千五百名自马赛启程来华。
16日，英国亦从本土和印度向中国派兵。
18日，德国军队八百人开进北京城。
19日，德国将领瓦德西率重兵自德国启程。
20日，22日，奥国水兵一百六十八人亦开进北京。意大利所增派军队，亦在途中。
各国侵略军进入北京后，大加杀戮、奸淫和抢掠，北京城顿时变成鬼蜮世界与人间地狱，被奸淫、杀戮者无以数计。其间黑兵见了妇女，尤加疯狂。此次抢劫，据内务府极不完全统计，被抢之物有《长白龙兴记念》四册、《历圣图象》四轴、《历圣翰墨真迹》三十一册、《玉牒》（草稿）七十六册、《穆宗实录》七十四册、《光绪朝起居注》四十五册、光绪御翰八册、西太后御笔、光绪御容各一帧、《丙夜乙览》一百三十五册、满洲碑碣六册、《历朝帝王后妃图像》一百二十轴、《宁寿鉴古》十八册、《皇华一览》四册、《发逆歼灭实录》四十八册，以及宫外未见之各种古版善本图书二十种；失去宝物二千余件，内有碧玉二十四颗；四库藏书四万七千五百零六本；金时辰钟二具、李廷珪墨一盒、琬瑶大屏四扇、玉马一匹、《发逆玺印》一本、真墨晶珠一串、太平天国将领林凤翔、洪宣娇牙齿一盒。据李鸿章、荣禄奏被抢者还有皇史崴虎纽银印三十四颗、满蒙汉实录圣训五十一函（二百三十五卷）；另外还有各寺庙祭器家具；天坛损失金、银、铜、瓷、锦等祭器一千一百四十八件，社稷坛损失银、玉、铜、瓷、竹祭器一百六十八件；俄军于嵩祝寺抢走镀金佛像三千余尊、铜佛无数，镀金器物四十件、银器七件、铜器四千三百件以及锦缎绣品一千四百余件、木刻珍品一千六百余轴等等。清政府六部亦均遭掠劫。日军从户部银库抢走二百九十一万四千八百五十六两白银，送人日本使馆，并抢走无数绫罗锦缎。内务府之三十二万石仓米和全部银两亦被劫掠一空。俄军于户部未抢到什么东西，就到总理各国事务衙门抢劫。翰林院则丢失数万册经史典籍，其中有《永乐大典》、钱法堂数万串铜钱、禄米仓数万石陈米，太常寺、光禄寺金银器皿，銮驾库的各色车马，均被劫掠一空。此外各种象牙珍品，失去无算。总计各库失款共约六千万两。德法两国，更将中国古观象台天文仪器瓜分掠回本国；各王公府第，亦被抢劫一空。礼王府（世铎），被抢走白银二百万两和无数珍玩；户部尚书立山家中抢走价值三百万白银之古玩和三百六十五串朝珠；军机大臣宝望家中抢走三十万两白银。联军对商号、当铺、居民的财物也不放过，“翻箱倒柜，无处不搜”，稍有拦阻，即被杀害。“各街巷行人，遇洋兵则遍身搜索，凡银钱不拘多寡，全行掳掠”。联军统帅瓦德西也完全承认此举为抢掠丑行。他于本年12月7日日记中谓：“所有我们亲爱的联军朋友们，业将一切抢来之美术、财宝、物品送回家中而去，其中许多物品，乃系属于私人产业”。俄国驻直隶部队司令官李涅维奇抢得十箱珍宝运回本国；法军司令官福里，则运回珍宝四十箱。总之，“西人及日本人出京，每人皆数大袋，大抵皆珍异之物，垂橐而来，捆载而行”。他们还把抢来珍宝，于大街小巷，进行拍卖，士兵成了“商人、小贩”。
8月中旬，北京为七国共同占领。德、美、英三国分占外城（德占珠市口以北之东西地区；英占天坛周围地区；美占永定门至广安门地区）；俄、德、美、英、法、意、日各国分占内城各地区：日本占朝阳门至德胜门、新街口、西直门以北地区；俄国占朝阳门、崇文门以内地区；意国占东四以西至皇城根地区与西直门至阜城门内地区；德国占正阳门至崇文门内地区；美国占正阳门至宣武门地区；英国占阜城门至广安门、西便门以内地区。皇城以内以外地区，亦由英、法、美、德、俄、日、意分别占领：德国占景山之东北角，意国占景山之西北，俄国占北海以西地区，法国占中南海以西地区，美国占前门至天安门西侧地区，英国占前门至天安门以东地区。至12月10日（十月二十日），不包括法军代表的“管理北京委员会”宣告成立。办事地点设在理藩院衙门。此与“天津都统衙门”同属殖民军管机构。
17日，西太后一行抵怀来县境，命荣禄、徐桐、崇绮留京办事。
18日，广东布政使岑春煊率兵保驾。
19日，西太后抵沙城堡，下懿旨：命岑春煊督理前路粮台。
20日，抵鸡鸣驿，光绪帝下罪己诏，兼诫中外臣工。
21日，抵宣化，命万本华、孙万林、奇克伸布诸军听马玉昆节制，殿后护卫。
22日，下诏求直言，免所过宛平、昌平等处一年钱粮。
27日，西太后抵天镇，命奕勖还京师，会同李鸿章与各国议和。
29日，抵聚乐镇。太监张天顺骚扰驿站，处斩。
30日，西太后抵大同，命刘坤一、张之洞会商和局。命载漪为军机大臣。
本月28日，八国联军在京举行阅兵式，俄军八百名在前，日军八百名在后；继之为英军四百名、美军四百名、法军四百名、德军二百五十名、意军六十名、奥军六十名。俄军李涅维奇陆军中将代表联军各司令官检阅部队。阅兵完毕，即入紫禁城游行。
唐才常拟于本月9日，率自立军五个军于各地（大通、安庆、常德、新堤、汉口）同时举义勤王，扶助光绪，废掉西太后。但因康有为对唐才常不信任，接济款项迟迟不寄，又延期至23日起义。唐旋被告密，唐才常、林圭等二十余人被捕，唐、林被杀害，陈犹龙等亡命日本。五军为：前军秦力山、后军田邦墙、左军陈龙、右军沈荩、中军林圭。陈等到日本后，对梁启超严词诘责，并严斥康党贻误大局之罪。梁启超无言以对，愤言将披发入山。自此之后，保皇党信用大失，海内外志士，开始有更多人归心孙中山之革命排满运动。
本月，沙俄政府擅自于中国旅大成立俄国“关东省”。“省政府”设立于抚顺，下设“民政厅”、“财政厅”、“外务局”、“警察局”、“省法院”。其下设五个辖区；并设立“关东军区”驻军司令官。
9月：
2日，西太后赏随驾王公大臣津贴银两。
3日，西太后等抵怀仁，命京师部院寺卿堂官及内廷行走者，除派留京师者外，均率司员赴太原行在。
5日，西太后抵广武镇，命程文炳统军驻防潼关。
6日，抵阳明堡，谕命荣禄收集整理武卫中军。
7日，抵原平镇，命廷雍“督剿”直隶拳民。
10日，西太后、光绪帝抵太原行在，以巡抚署为行宫；免路过各州县本年额赋。
12日，令荣禄约束武卫中军。
17日，光绪下诏劝教民安业，拳民被裹挟者归农。
20日，德国将军瓦德西于香港Hartha舰树立帅旗，正式就任东亚海陆军总司令职。
25日，抵大沽口。
27日，抵天津。李鸿章亦同时自沪抵津。
28日，俄军一部越过芦台、唐山，占领开平、古冶，继续向山海关进犯。
同日，清廷诏命记名提督郑才盛交出（山海关）炮台，至迟不能超过10月2日，列强并通过在天津之外交官科罗托维茨与李鸿章面商，迫李鸿章指示副都统富顺和郑交出山海关。李则顺从其意，给郑写信劝交。但在俄国人奔走之时，英国海军则于29日派专使喜在明（驻朝鲜领事），由瓦德西侍从武官鲍维尔上校陪同，乘“矮人”号军舰抵山海关与副都统富顺、县令俞垚钦进行会谈，达成清军交出山海关协议，清军五营便放二排空枪后撤走。英军抢先占领山海关火车站和五个炮台，并马上停开火车，以免他国军队开来。
本月24日，赈济浙江丽水等县水灾。
本月25日，清廷为此次攻打使馆引咎自责，并表示惩处有关诸王大臣。光绪谕旨曰：“此次中外开衅，变出非常，推其致祸之由，实非朝廷本意，皆因诸王大臣等，纵庇拳匪，启衅友邦，以致贻忧宗社，乘舆遥迁（皇室亡命）。朕固不能不引咎自责，而诸王大臣等无端肇祸，亦亟应分别轻重，加以惩处。”所列应加惩处之王公大臣为：庄亲王载勋、怡亲王溥静、贝勒载濂、载滢，均革去爵职；端郡王载漪，着从宽撤去一切差使，交宗人府严加议处，并停俸。辅国公载澜、都察院左都御使英年，均交衙门严加议处。协办大学士吏部尚书刚毅、刑部尚书赵舒翘，交都察院、吏部议处，以示惩儆。继曰：“朕受祖宗付托之重。总期保全大局，不能顾及其他。诸王大臣等，谋国不臧，咎由自取，当亦天下臣民所共谅也。”
同日又谕李鸿章进京议和：“所奏各节，本日均已照办，分别降旨。该大学士接奉此旨，着即日进京开议，勿再迟延”。次日，又谕内阁，命派礼部右侍郎那桐前往致祭日本使馆书记生杉山彬，并赔葬银五千两，运回日本。
同日，命内阁，派大学士岜冈即日前往祭奠德国公使克林德。
同日，命鹿传霖为军机大臣。
26日，派那桐赴日本致祭被甘军所杀之日本书记生杉山彬；毓贤罢官。
29日，驻大沽各国海军继续召开会议，决定由海上登陆秦皇岛，同时派一批军舰，前往轰击山海关炮台，牵制中国驻军，掩护登陆部队；俄军占领滦州。
同日，光绪谕内阁：因山西本年荒歉，供应维艰，加之山路崎岖，转运困难，且电报不通，诸多不便，特决定于10月1日（闰八月初八日）启銮赴长安。
10月：
1日，西太后等启程，向长安进发。
6日，抵霍州，诏命荣禄至行在（皇帝所在之处）。
10日，抵史村驿，谕北五省严捕自立会党。
同日夜，俄军知英军已占山海关，立即赴山海关，占领铁路学堂，英、俄双方有冲突之险。联军即派一支联合舰队驶往秦皇岛登陆，输送联军七千人，于10月24日进入山海关，协调各国军队：第一号炮台各国军队共同占领，升各国国旗；第二号炮台由德、奥、意三国共国占领，第三号炮台与火药库由法军占领；第四号炮台由英、日军占领；第五号炮台由俄军占领。正当此时，俄军一部暗中占领车站和山海关桥梁工厂。联军继而侵占关城，烧杀抢掠，无所不至。并闯入乡村和南北翼城烧杀淫掠。英、德军继侵宁海县城。
2日，德、法联军占领秦皇岛。俄国新任太平洋舰队司令海军中将斯克雷德罗夫率舰队运俄军三千人自旅顺口抵山海关登陆。
3日，清廷授奕勖全权大臣，会同李鸿章协议和约，刘坤一、张之洞会商和约。
同日（10月3日）英军芮德准将，率领一千二百人从威海卫驶抵山海关和秦皇岛，任山海关、秦皇岛两地联军指挥官。英国海军中将西摩尔返回大沽口，联军复于山海关、秦皇岛淫掠烧杀，无所不为。10月10日，俄军攻掠卢龙县城。11日，德军侵入永平县城，将东街抢掠一空，并于该县勒索大量白银。
4日，法国政府向侵华各国政府提出对华谈判六条作为谈判基础。各国原则上予以接受。主要是：惩办各驻华使馆指定之主要“罪犯”；禁止军火进口；对各有关国团体、个人损失作出公正赔偿；在北京建立永久使馆队伍；拆毁大洁炮台；对北京至大沽间几处地点进行军事占领。
15日，奕勖和李鸿章向各国使节提出一个照会表示：中国就进攻使馆一事向各国认罪；同意赔偿损失；同意修订新通商条约；新约订好后各国撤兵；谈判前，各国应先行停战。
7日，两宫（西太后与光绪）抵蒲州，谕命江苏等省解款百万两，接济京师俸饷。免西行所过太原、阳曲等属今岁额赋。
8日，孙中山领导下之反清义军统将黄福率敢死队八十人，奇袭清军于惠州沙湾，夺洋枪四十支、弹药数箱，斩杀四十余人，俘获三十人，清军溃败，惠州三洲田起义爆发（亦有云10月6日，或10月5日爆发）。次日，孙中山复电，令郑士良率部从海道接受来自台湾、厦门之军械。郑复于平山、龙冈招募千余人。于15日攻克镇隆，夺枪七百余杆、马七十匹。
至17日，清军援军万人增援至惠州三洲田。郑以义军势单力薄，决定奇袭克敌，率众猛攻永湖，一举而下。沿途军纪良好。百姓以酒食相迎于道，各地来投者，竟达数千之众。同日，义军又连败清军，占领白芒花。此役击伤清军将领刘邦盛、邓万林，夺洋枪六百杆，马数十匹。19日，义军进占崩冈墟，入夜，复袭清军，大胜，但因人多枪少，弹药不继，义军追至沙洋而止。本月下旬，义军继占新安、大鹏，进军惠州、平海沿海地区，此时义军已达两万余人。但枪械显然远远不够。孙中山所派使者山田良政由香港抵达，告知：“情势突然生变，外援难期，即至厦门，亦恐徒劳，军中之事，由司令官自决行止。”郑士良接信后，悲痛不已，即日洒泪解散起义军，化整为零，保存实力，以图再举。郑等先后赴香港；山田良政在归程中，被捕殉难，为日本志士殉节中国革命之第一人。
此次起义期间，史坚如、邓荫南，于广州欲以炸弹刺杀两广总督德寿，未能成功，史坚如被捕，于11月9日，慷慨就义，年仅二十二岁。
此次起义，震动世界，各国报纸纷纷刊载此次起义之新消息。
12日，瓦德西以保定府驻有清军，天津、北京、保定间，仍有义和团在活动，派联军两路进犯保定，指令对义和团进行残酷镇压，搜到拳民，立即枪决；对清军则可与之接洽，共同镇压义和团，并转向议和局面，但要清军退出保定府城以南一百华里外驻扎。联军携带二十一天粮饭（此时联军多有患痢疾与感冒者）出发：一路由法国旅长白劳德率领，自天津出发，计四千余人，另一路由英国侵华军司令官盖斯里陆军中将率领，自北京出发，计有五千余人。
13日，法军一支，先抵保定城下。
15日，法军未经作战，进驻保定府城。
18日，联军两支抵保定，并进入正定县城，抢掠一空。
21日，联军占据保定城内总督署。
23日，联军将直隶布政使廷雍、城守尉奎恒、参将王占奎、按察使沈家本、候补道谭文焕等清朝官员俘获。
25日，德寇于完县境内杀人放火，肆无忌惮。
31日，联军犯永清县城，勒索白银四千两。
16日，英国和德国签订《英德协定》，此协定第二条规定：“德帝国政府及英女王陛下政府，不得利用现时之纷扰，在中国获得任何领土利益，其政策应以维持中国领土不受变更为指归”。第四条规定：“两国政府应将本协定通知其他关系列强，如奥、法、意、日、俄、美等国，并请其接受本协定所采取之原则”。
17日，联军统帅瓦德西抵达北京，将统帅部设于皇宫中。
19日，法国驻华公使根据各国公使所提修改意见，提出对华议和六条修正案，作为对华谈判基础。
26日，西太后与光绪逃抵西安，以巡抚署衙为行宫。
29日，联军突然向紫荆关（晋冀交界处）发起进犯，清军与之激战六个小时，因力量不支而撤退，后因联军和各国公使之间，对于进攻山西之意见未能统一，联军侵占紫荆关后暂驻该地，未再西犯。
11月：
6日，经瓦德西批准，被俘获之清廷官员王占奎等“受国际审判”。以纵容团民杀害教士为由，将廷雍、王占奎、奎恒三人“判处死刑”；把沈家本革职并予以监禁；将谭文焕押往天津受审。对此，逃亡在外地之清廷，提出了质询和抗议。此外，联军还对保定城进行了摧毁性的破坏，城门、城角均拆毁无余；还勒索保定府二十四小时内交出四万两白银，又罚银十万两，限一月交齐。联军对保定城乡，复行一贯之烧杀淫掠，并以“清剿义和团”为名，大肆屠杀城乡百姓，血染保定地区。联军又犯固安县城，勒索白银八千两。于定县攻打高蓬镇，继犯曲阳县，攻击义和团队伍。此外联军还到新城、涞水、易州各城乡进行烧杀抢掠。复到清西陵，奸淫妇女无数；并当着青年丈夫之面强奸其青年妻子，毫无人性。乡人多以全家自焚而免其辱。联军复于西陵抢劫，甚至连门窗的铜片，也不放过。在此广大地区之罪恶丑行，直至1901年夏天，才因开始撤军而收场。西陵被劫金、银、铜、木各类祭器共五千五百六十件，几经交涉，退回五千零五十一件，多已损坏不整。
9日，清廷予此次殉难的祭酒（官名）王懿荣世职并旌表其妻谢氏、儿媳张氏。
12日，德、意、奥三国军队由北京向张家口进犯。总兵力一千五百人，大炮四门，一路未遇到什么抵抗，经南口、居庸关、延庆、怀来，于17日进驻宣化府城，勒索保险费二万两。
18日，抵张家口，守军献城迎敌，联军再次于张家口与附近州县大肆抢掠，并闯入民宅奸淫妇女无数，复行种种勒索，因天寒地冻，于本月23日，又离张家口返京，沿途除抢掠奸淫之外，复一批批屠杀“义和团员”。此后两次自北京向张家口进犯。1901年5月，十六名德国骑兵又入侵山西省天镇县，抢掠而后，又侵入大同府、阳高县境和丰镇厅，并有德军再次进犯张家口，焚毁营房数十所。
同日（11月12日）清廷免保德贡黄河水鱼。
13日，清廷削载漪爵，将载勋、溥静、载滢交宗人府圈禁；载澜、赵舒翘夺职留任；刚毅病故免议；毓贤发配到极远边疆。
15日，德军攻陷紫荆关，布政使升允退军浮图。
24日，德法联军在保定成立“权理司”，作为统治保定地区人民的机构，并于12月15日派军攻打容城县城和满城，到处抢掠和勒取大量银两。
30日，联军各国政府驻华公使最后议定议和大纲十二条。
本月，赈陕西灾荒。
12月：
3日，朝廷下诏责董福祥不谙外情，遇事鲁莽，夺提督职仍留任。
4日，发内库银四十万两赈陕西饥民，并促江、鄂转漕购粮，以接济之。
4日，调崧番为陕甘总督。
6日，授王文韶为体仁阁大学士，崇礼、徐郙并协办大学士。
16日，光绪谕命内阁：锡良、岑春煊奏请开陕西、山西实官捐输（开价卖官），以资赈济。山西、陕西两省，灾区甚广，筹赈维艰，按其所奏，准开办实官捐输。
22日，对上月所拟十二条议和大纲，各国公使完成签署手续。随后。各国公使将大纲十二条以照会形式，送交清政府议和全权大臣奕勖，奕勖与李鸿章立即电告西安。该十二条如下：（一）杀死德使一事，中国派亲王赴德赔礼，并于被杀处立碑纪念（即克林德碑）。（二）严惩“肇祸”诸人；“杀害凌虐”外国人各城镇五年内不得举行文武考试。（三）杀死日本书记生一事，中国政府必以优荣典礼以谢日本政府。（四）发掘外国人坟墓之处建立碑碣。（五）军火及造军火之材料不准运入中国。（六）中国政府赔外国人及为外国做事人损失。（七）各国派军常驻，保卫在华使馆。（八）京师至海边留出外国来往通道；大沽炮台一律拆毁。（九）各国派军驻屯保卫通道。（十）张贴永远禁止军民人等仇视外国之谕旨。（十一）修改通商行船条约。（十二）改变总理各国事务衙门及各国公使觐见礼节。照会称此议和大纲“极为持平，若中国不允从，或仍与磋磨……和局必致决裂”。奕勖、李鸿章则谓此照会：“词议决绝，不容辩论……稍一置词，即将决裂，存亡之机，间不容发”；又云：“如蒙电旨谕允，以后撤兵、回銮皆可次第就绪”。
27日，光绪特谕军机大臣等，同意各国议和大纲十二条：览所奏各条，曷胜感慨，敬念宗庙社稷，关系至重，不得不委曲求全，所有十二条大纲，应即照允。惟其中利害轻重，详细节目，著照昨日荣禄等电信各节，设法婉商磋磨，尚寄稍资补救。该王、大臣等勉为其难，惟力是视（尽力而为）可耳。此后，清廷即于十二条议和大纲上签字画押，加盖玉玺，于1901年初送交各国公使，和议大纲基本确定。此后是各部分之细节问题，共商讨七十余次，数月后才最后确定全部内容。于以上讨论过程中，联军向晋、鲁进犯，以争取更多权益。
28日，清平苗民王老九反清起义，王为清军捕获。
本年，沙俄侵占中国东三省。在八国联军进攻京、津及自京津向华北各地野蛮侵略过程中，沙俄一方面派军参加对京、津之武装侵略，另方面又乘机派兵十一万人，编成四个军团，分兵七路，入侵中国东三省。中国军民于各地奋勇抵抗，但损失惨重。8月3日，俄军侵占哈尔滨。8月5日，俄军侵占瑷珲城，军民一千五百余人，抗战殉国。8月25日，俄军侵占齐齐哈尔城，将军寿山自杀殉国。9月22日，俄军侵占吉林省城，烧杀抢掠，奸淫妇女，银元厂十万两白银被抢劫大半。10月1日，俄军侵占奉天。10月4日，侵占锦州，东三省完全沦陷于俄寇之手。
在俄军侵略东三省过程中，东三省军民奋起抵抗，俄军进行疯狂报复，制造海兰泡和江东六十四屯大血案。海兰泡位于黑龙江左岸，精奇里江右岸，为两江汇合处，原是中国的一个村庄，于1858年《瑷珲条约》，被俄国夺为己有，中国农民仍居住其中。此地以后成为俄国阿穆尔首府，有中国侨民一万五千人。本年7月15日，瑷珲城清军炮击来犯俄军舰只，击伤俄军官兵七人。疯狂已极之俄军即迁怒于海兰泡中国侨民，7月17日，逮捕海兰泡中国居民四千余人，赶至黑龙江边，用大刀和刺刀狠命砍杀，一时间尸满江中，江水尽红，最后只余八十人冲过江右岸进入中国领土。大屠杀持续到7月21日，有五千余中国人被无故屠杀，连幼儿也不饶过。
与此同时，俄寇又越过精奇里江，将屠刀挥向江东六十四屯。江东六十四屯，位于黑龙江左岸（东岸）精奇里江江口以南，南北长二百余里，东西宽九十余里，有中国人两千余户，原是中国领土。1858年《瑷珲条约》将六十四屯，划归俄国，但仍由原中国官员管理，原中国居民享有在该地区之永久居住权。俄军在六十四屯逐屯烧杀，逃到江边之中国居民难以渡江，又被赶来之俄国兽兵，乱枪射杀。血染江水，尸蔽江面。
江右清军，见之不忍，派军渡江包抄俄军后路，击败俄军，并接回部分中国屯民。7月18日，俄军又于博尔多屯枪杀中国居民千余人，未能渡江的中国人，尽数被赶入江中淹死，数日后尸散江面。江东六十四屯中国居民除少数被救出外，全部被俄军杀光。海兰泡、江东六十四屯大屠杀中，无辜的中国男女包括幼儿有七千余名被屠杀，此即震惊世界之海兰泡、六十四屯大血案。7月下旬，俄人又于三姓城屠城，城中男女老幼，一概杀光。不留一人，并将富克锦至三姓城沿松花江两岸居民房舍尽行烧光。此段历史我中华子孙凡有良知与血性者，均应牢记。
本年，孙中山论庚子事变前后民心之变化。论曰：“经此次失败（惠州起义）后，回顾中国之人心，已觉与前有别矣。当初次失败也（1895年乙未起义），举国舆论，莫不目我辈为乱臣贼子，大逆不道，咒诅谩骂之声，不绝于耳。吾人足迹所到，几被识为毒蛇猛兽，而莫敢与吾人交游也。惟庚子（1900年八国联军入侵）失败以后，则鲜闻一般人之恶声相加。而有识之士，且多为吾人扼腕叹惜，恨其事之不成矣。前后相较，差若天渊。吾人睹此情形，中心快慰，不可言状，知国人之迷梦，已有渐醒之兆。加以八国联军之破北京，清帝后之出走，议和赔款九万万两而后，则清廷之威信，已扫地无余，而人民之生计，从此日蹙，国势危急，岌岌不可终日，有志之士，多起救国之思，而革命风潮自此萌矣。”
本年，荣氏兄弟（荣宗敬、荣德生）创办保兴面粉厂。
