人们知道，目前的美国战略C3I系统旨在加强对核部队的指挥与控制能力。那么，核战争时，战略C3I系统将怎样工作呢？假如敌国的洲际弹道导弹向美国袭来，战略C3I怎样大显身手呢？
首先，美国东半球的预警卫星发现了敌国导弹的发射。这一情报通过卫星传给了美国科罗拉多州夏延山内的北美防空防天司令部。西半球的卫星同时探测到了潜射导弹。随后，美军全球系统中有关部分，即从阿拉斯加克利尔到英国“菲林代尔斯”以及部署在美国周围的雷达证实了导弹正在来袭途中。以上是战略C3I系统中的侦察探测预警系统在工作。这时，北美防空防天司令部早已行动起来，它的一台计算机正在计算有多少导弹及飞向何方。另一台计算机处理进出的信息流，并将计算结果发往战略空军司令部、国家军事指挥中心和国家军事预备指挥中心。这三个中心还直接接收来自监视潜射导弹发射的卫星和雷达的读出数据。
这时，北美防空防天司令部和其他三个指挥所的值班官员立即召开“导弹显示会议”。一两分钟内，他们肯定了这一情报的真实性，并报告他们的上级，随即进入“威胁鉴定会议”阶段。此阶段，战略空军司令下令其戒备轰炸机准备在潜射导弹飞抵前几分钟时起飞。在夏威夷，太平洋总部空中指挥所升空。其“核总部”——大西洋总部和欧洲总部的空中指挥所也很快升空。
实战的战略部队在战略C3I系统的指挥控制下的行动是：在得到警报5分钟之内，B—52和FB—111轰炸机起飞，在接近敌国领空前，若无进一步命令，它们将折返。几分钟后，四个地面指挥中心向白宫通信中心发送他们的威胁鉴定报告。
总统参加“导弹攻击会议”，以及决定下一步行动。在明确即将遭到袭击的情况下，总统登上直升机，前往华盛顿郊区的安德鲁斯空军基地。总统、国防部长、三军参谋长登上在基地待命的波音747飞机，即“国家紧急空中指挥所”。
这时，总统需要做出最困难的决定：是命令战略空军司令部在敌国一开始攻击时便发射自己的“民兵”洲际弹道导弹呢？还是等待弄清敌国的核武器将在何处、何时爆炸时再发射呢？
如果总统决定发射导弹，贴身的军事人员就启用“执行密码”。这种密电可以向军事指挥官们证实它确是总统下达的命令，总统确实批准了发布紧急行动电报。国家紧急空中指挥所可能经过卫星把电报发送出去。此时，美战略空军司令部的机载指挥所将把向敌国发射导弹的命令发向各导弹发射指挥中心，即把向敌国投放核武器的命令传达到密苏里、北达科他等导弹发射控制中心。
与此同时，在大西洋上空盘旋的“塔卡木”中继机已将紧急行动电报传给了水下的弹道导弹潜艇。潜艇已做好了发射核导弹的准备。此后，各指挥所将收到反馈数据和情报信息，以便估计自己所余资源、战争继续下去的可能性。
假设在遭核攻击后，地下指挥所被毁或失灵，这时便由EC—135型飞机指挥战略空军司令部所属部队以重复线路与海军弹道导弹潜艇进行通信（该机上设有三部甚低频／低频无线电通信设备）。为了加强遭核攻击后的指挥控制系统，美军于1962年扩充了空中指挥所，增加了东、西、中三个辅助指挥所以及一些中继飞机和一些空中发射控制中心，它们一起组成攻击后的指挥控制系统，继续实施对核部队的指挥与控制。
