夜晚，天堂岛上的另一座城市——波涛市。
五个光之美少女、四个忍者神龟、柯南和小樱在市区的一栋建筑物顶无法想像这里居然不是SH及多个国家的城市。
日野茜抱怨：“如果我当初不该去救那几个来路不明的人，否则我们几个也不会出现在一个陌生的地方。”
青木丽华安慰日野茜：“事已至此，我们已别无选择了，我现在只想知道这是什么城市？”
拉斐尔怀疑：“这里会不会又是以前的死敌施莱德的老窝？”
达芬奇提醒拉斐尔：“施莱德早就在那个时候消失了，不可能会再次崛起的。”
小樱知道柯南是一个少年侦探，他一定知道有关这座城市所有的信息。然而面对这样一座现实不存在的城镇，柯南也无能为力告诉小樱：“我根本没办法了解事情的真相。”
听了这句话，众人陷入了一个难题：“到底是谁把我们带到这的？”
多纳泰罗认为在这个城市的数据库一定能知道这个地方的来源，只是唯一让众人感到麻烦的事：“不知为何，众人突然成了整座城市的眼中钉！”
尽管如此，星空美幸还是坚决的说：“必须去那个地方，因为那还有一个回家的办法。”
黄濑弥生和米开朗基罗充满喜悦的支持星空美幸，想和星空美幸同去，却被达芬奇制止：“因为你们去可能会引起当地军队的注意。”
无奈，星空美幸选择与达芬奇一同前往“数据库”找到能够回去的办法。
星空美幸和达芬奇走后，柯南想知道那些带他们来这的传送点的来源到底是哪里？
多纳泰罗向柯南建议：“去那座靠近城市的发电厂，也许那里可以知道答案。”
经过这一决定后，柯南和小樱决定去那个“发电厂”看看。
柯南和小樱走后，剩余的四个光之美少女及三个忍者神龟决定先在这瞧瞧，但最好别被发现。然而，一群忍者却突然发现了他们......
在天堂岛靠近海边的城市——滨海市区的大厦顶楼内的办公室。
红秀丽坐在办公桌前的办公椅上手拿话筒听电话。
接电话的人非常感谢彩云国企业对黑翼军团的大力相助，现在黑翼军团已经有超过10万架由彩云国企业出品的“暴风机甲”及“黑铁机械士兵”。
红秀丽却在用话筒对接电话的人说：“小意思了！但这件事最好不要向各国透露。元首是个自负心很强的女人，你现在唯一办法就是不能让那些机甲全部倒卖到东南亚去。”
说完，放下话筒。一位员工走了进来。她说：“元首答应了您的请求，收购了我们出品的大部分机甲。黑翼军团已经强大到无人可比。”
红秀丽离开办公椅走上前去提醒员工：“数个月后就是元首梦寐以求的“伊斯雷之日”，我们彩云国企业也对搞个机会，帮她的忙知道吗？”
员工谨遵从命，红秀丽回到办公椅上，脸上却显得格外悲哀......
柯南和小樱来到由电栏围护的发电厂，小樱随即用星之杖召唤“火”牌将电栏烧个破洞，两人悄悄进入发电厂。
四个光之美少女和三个忍者神龟在多处建筑物上，米开朗基罗非常爽快的说：“这里比纽约还要好多了。”
谁料，众人跳到最大的建筑物上居然发现昔日的冥斗士-天猛星拉达曼迪斯出现在了众人的眼前。
绿川直很不喜感的责问拉达曼迪斯：“你到底是如何复活的？”
拉达曼迪斯却说：“这么想知道吗？”
拉斐尔说：“当然想！”
说完，一大群忍者却突然包围了众人，拉达曼迪斯得意的笑道：“你们已经自投罗网了！”
另一方面，柯南和小樱在没被军队发现的情况下悄悄走到发电厂的走廊。
柯南很不明白这里为什么和传统的发电厂不一样？
小樱说道：“也有可能是因为受切尔诺贝利的影响吧？”他们在走廊找啊找都找不到传送点的来源。
忽然，一个惨叫声被他们听到。柯南和小樱走到门前偷听到爱德华·艾尔利斯和见崎鸣在审问一个人。
两人走了进去躲在箱子后边发现那个人居然是被绑在平板上的塞巴斯蒂安。
而爱德华·艾尔利斯和见崎鸣却对塞巴斯蒂安说：“这是元首给你的唯一次机会，马上告诉我们暴乱分子的藏身处。”
塞巴斯蒂安宁死不肯说，见崎鸣就用匕首在塞巴斯蒂安身上刮几个疤痕，柯南见状直接用蝴蝶结变声器发出军队士兵的声音叫爱德华·艾尔利克和见崎鸣过来。
两人走了过去，小樱趁机用星之杖召唤“剑”牌手持剑击倒了爱德华·艾尔利克。
见崎鸣发觉上当，直接从背后拿出两把冲锋枪对小樱和柯南两人开火。
两人迅速各自躲开，见崎鸣随后又拿出激光剑上前攻击小樱，警告她：“你打扰了我们的正义审判。”
小樱手持剑与见崎鸣打在一起，说：“我根本就不知道你这个“正义审判”是什么意思？但我最看不起你们这种虐待人的审判！”
随后小樱召唤“岚”牌将见崎鸣吹走。谁知，爱德华·艾尔利克用机械手臂偷袭了小樱。
柯南按下脚力增强鞋的按钮从足球腰带喷出足球用脚力增强鞋踢中爱德华·艾尔利克。
柯南说对爱德华说：“我要知道到底谁才是二流的元首？谁把你变成二流的暴徒。”
爱德华·艾尔利克却笑了起来说：“这句话你还是等到明年再说吧！”
柯南顿时奇怪。突然，阿尔冯斯·艾尔利克从顶部直接跳了下来，声称：“我要替哥哥打败你这个四眼小鬼。”
柯南惊讶的往后退发现背后的箱子里竟藏了多把激光剑。于是柯南从箱子里拿出一把激光剑与阿尔冯斯·艾尔利克打在一起。然由于激光剑的电源耗尽，柯南最终被阿尔冯斯?艾尔利克打在地上。
就在阿尔冯斯·艾尔利克准备一举了结柯南的性命时，小樱用星之杖召唤“击”牌锁定目标击倒了阿尔冯斯·艾尔利克。
爱德华·艾尔利克要弟弟赶快带他和见崎鸣离开，阿尔冯斯·艾尔利克带着爱德华·艾尔利克及见崎鸣逃走了。
小樱扶柯南起来，两人合力将塞巴斯蒂安救出。
小樱想问一问塞巴斯蒂安：“他们为何会折磨你？是不是你真的得罪了那个“元首”。”
塞巴斯蒂安不以为然，但他先提醒两人：“过去我就是因为对元首的残暴统治感到不满，我试图联络反抗者结果却被抓起来了。他要两人马上离开，不然他们会找你算账的！”
就在这时，柯南的耳环型手机却突然响起了多纳泰罗的声音：“救命！我们被袭击了！”
两人大惊，柯南想问多纳泰罗到底是谁，多纳泰罗回答：“拉达曼迪斯！”
说完耳环型手机便挂了。柯南和小樱想过去看看，转过身发现塞巴斯蒂安不见了......
此时的众人却在建筑物屋顶上与一群忍者打在一起，终于合力将忍者打倒。
拉斐尔怒诉拉达曼迪斯：“你是从哪来招收的忍者？”
拉达曼迪斯却说：“这些可是黑翼军团的精英部队啊！被你们打残了我怎么向元首交待啊！”
日野茜盛怒之下警告拉达曼迪斯：“不准在这里撒野！”
于是，众人与拉达曼迪斯很快地打在一起，结果众人被击败。
拉达曼迪斯很兴奋的说：“我终于有史以来打败了第一个变异人物。”
说完，他打算杀死黄濑弥生。不过就在这时，柯南和小樱及时赶到救出了黄濑弥生。
拉达曼迪斯骄傲的说道：“以前是圣斗士，现在连普通人也要打败我吗？”
小樱指责拉达曼迪斯：“只统治你的冥界还不够吗？”
拉达曼迪斯却认为：“这个地球政府和以往的冥界还要普通，联盟是理所当然的，所以我现在忍受人类，即便是那几个圣斗士小鬼！”
话刚说完，小樱和柯南便分别手持剑及激光剑与拉达曼迪斯打在一起。很快将拉达曼迪斯击飞。
突然，一个闪电接住了拉达曼迪斯。众人走上前一看接住并保护拉达曼迪斯的居然是已经穿上冥斗士盔甲的天马星矢、天龙紫龙、天鹅冰河、仙女瞬、以及凤凰一辉！
柯南想问他们：“你们为什么会成为冥斗士？！”
星矢认为：“拉达曼迪斯是对的，恐惧比意志还要更有效。”
拉斐尔怒道：“所以你抛弃了光明懦弱的选择黑暗！”
但星矢却说道：“我还是秩序的守护者！”
拉斐尔二话不说与星矢打在一起。绿川直想去帮忙，却被冰河击飞。
星矢告诉众人：“伪善者想得简单，他们本来......”
拉斐尔打断了星矢的话，他要替女神雅典娜揍扁这个“叛徒”！
结果众人与五个冥斗士再次打在一起。最后冥斗士被击败，在拉达曼迪斯说完最后一句：“这还不算完！”就带着五个冥斗士逃走了。
黄濑弥生和感到害怕，说：“现在我满眼都是黑暗。”
就在这时，远处的军队到来了。米开朗基罗想劝大家赶紧逃。众人无奈只好逃走。
另一方面，一栋建筑物上放着采访红秀丽的报道。喜羊羊、阿尔托莉雅、乌贼娘、茵蒂克丝四人走到无人的小巷处。
乌贼娘不明白的说：“难道我们就这样躲军队？”
阿尔托莉雅认为：“当时现在最主要的情况就是得找到藏身处——一个没被军队发现的地方。可是现在大街小巷都是军队的眼线，上哪躲得开那些军队。”
忽然，那名少女又再次出现在了众人的面前。众人大惊，喜羊羊看着少女的脸庞说道：“你是......”
滨海市的大厦20楼的会议厅。红秀丽在接受完记者的采访后告诉一位女秘书：“千万不要让他们知道我背对他们做什么？”
女秘书不解的问：“为什么？”
红秀丽却说：“没有为什么，你走吧。”
女秘书只好离开，红秀丽从背后拿出梦原希与伙伴们在一起的照片......
城堡中间的高塔内的办公室，梦原希坐在办公桌前的旋转王座上喝杯中的红酒。
穿着旗袍的露易丝走了进来安慰梦原希：“其实上次也不是你的错，梦原希。如果你早先知道那个恐怖天使就是你的爱人，你的同伴也不会随着你的家乡一起灭亡了。”
听了这句话，梦原希继续旁若无人的看着桌上画框内的照片。
露易丝想问梦原希：“确定不留下来陪自己？”
梦原希回应道：“当然可以。”
露易丝说：“我对你的心情很了解，我希望元首您能从阴影中解脱出来。”
不过梦原希告诉露易丝：“我现在想安静下来”，露易丝只好离开。
梦原希离开旋转王座看着窗外的景色。爱德华·艾尔利克却在这个时候走了进来告知梦原希：“我和弟弟发现了入侵者，他们把犯人塞巴斯蒂安从发电厂救走了！”
梦原希沉默了起来，她要爱德华·艾尔利克通知所有人，她要知道那些入侵者到底会集结在哪里？
