万历四十五年八月癸巳朔，巡按福建监察御史李凌云奏称：『本年四月十九日，有台山游兵船一只送回董伯起，随为官兵阻于黄岐。海道副使韩仲雍驰至小埕，召倭目明石道友、通事高子美等译审之。其长岐一岛——彼名为肥前州，岛酋村山等安——我呼为桃员者，近受武藏总摄之命，监主市易、交关唐人者也。明石道友，乃领其倭出贩，渠率而正木矢次衙门——实等安亲随典计之仆，其一人柴田胜左卫门则船中头目也。因问其何故侵扰鸡笼、淡水？向故谋据北港？何故擅掠内地与挟去伯起、复送还伯起及侵夺琉球等事？俱以甘言对。道臣因谕以「所经浙境，乃天朝之首藩也。迤南而为台山、为礵山、为东涌、为乌坵、为彭湖，皆我闽门庭之内，岂容汝涉一迹！此外，溟渤华夷所共，穷兵芟薙，汉过不先。但汝为飘风所引，暂时依泊，不许无故登岸；或为旷日所误，望山取汲，不许作意淹留。我兵各有信地，防御驱逐，自难弛纵，汝所过之处明声禀而速扬去可矣」。明石等复自请归岛之日，启知国主查实先犯料罗、续犯大金之人如系何岛商倭，则戮之国中；如系唐人拨置，则差倭缚送于境上：以表效顺。道臣谕以「使命往来，既非疆吏所得擅议；且本省奏闻发落，尚延时日。汝船经由港澳，或招猜衅。今汝国中一动一静，我院、道、镇、参悉见悉闻；果能不食斯言，自是汝国长利也」。旋又谕以「上年疏球之报，谓汝欲窥占东番北港，传岂尽妄？但天朝因汝先年有交通胡惟庸、擅杀宋素卿辈与误信汪五峰辈频年入寇，近复有平秀吉侵扰高丽诸事 ，悬示通倭禁例益严。其实每岁引贩吕宋者一十六船，此等唐货岂尽吕宋小夷自买而自用之乎！又各远屿穷棍挟微赀、涉大洋，走死骛利于汝地者，弘纲阔目，尚未尽绝。汝若恋住东番，则我寸板不许下海、寸丝难以过番，兵交之利钝未分，市贩之得丧可睹矣」。明石道友等各指天拱手，连称「不敢」！道臣随差官押送定海所而去。该抚臣黄承玄看得闽海多事，正在戒严，乃有倭目送归挟虏之报；其言颇甘，其来亦似乎有名。惟是狡夷变诈，原自难测。无论表文书词，种种舛谬；且大金、料罗之氛未远，而款关效顺之使突来，果可遽信其输诚乎！计惟量为抚恤，以昭绥怀之仁；仍即谢遣，以杜窥伺之隙。在彼为诚为伪，不足深较；在我保疆固圉，自难暂弛也』。章下所司。
（丙申），巡抚福建右副都御史黄承玄疏奏：『倭夷奉书归掳一事，言往者家康匪茹，狡马有窥我南鄙之心；而长岐之酋曰等安——即桃员者以他事得罪家康之灭之也，乃力请取东番以自赎；是以去夏东涌之警，而等安次子实来。会我汛事戒严，弗克逞志于我；播越离逿，不知所止。等安乃复缮舟厉兵，索其子于我境上，是以去冬有大金之入。至今日之局，又稍变矣：家康物故，其子代之，欲有事于东番；而国人未附，且恐中国之议其后也，于是内逆外顺、乍翕乍张，此方摇尾款关，彼复张牙肆毒。即谓先后合谋，或未必然；要其出于一岛之人，则彼已直任无辞者：又安得尽信夷使之口而终保其无他哉！惟是鳞介异类，毋足深求。今于其伺我疆场者擒而芟之，使知吾天威之严；于其就我戎索者姑恤而遣之，使知吾皇仁之大。至其通好之说，断不可稍假借以开异日无穷之祸也』。是日，巡抚福建右副都御史黄承玄复奏：『五月十一日，东沙外洋有倭船三只为风所破，倭贼二百余人栖泊本山修〈舟华〉劫抢。巡海道韩仲雍同兵备道卜履吉、参将沈有容行北中南三路及伍防馆合势仰攻 ，十六日早遥见大乌船一只、小渔船二只从远洋来——是伊同宗倭贼前来接济者；我兵奋击，三船立沈。倭贼投溺、就缚，水标所部解献生倭大头目三名、众倭三十名，总旗标下所部解献生倭一十二名，巡福宁道标下所部解献生倭二十二名；各获盔甲、刀铳、倭器充斥，复救回被虏渔民二十二人：则获罪我闽之定案也。及台州东、西机捕盗余千军民兵十一名，因称原三船中一大乌船即杀伊兵一十八人，重伤、放去各七人——而胁驾以来者：则获罪彼浙之确证也。又分巡福宁道右布政使黄琮报：把总何承亮追倭极东外洋，围袭倭船一只，捞斩二级、擒缚二十二名、救获被虏四名。见获桃烟门等六十七名，皆长岛倭也。因酋长等安遣其子秋安谋犯鸡笼、淡水屡失利，不敢归岛；复遣桃烟门等觅之。随以未获，住泊五岛。至今年四月，驾至浙台地方，冲过彼寨，兵船打破；旋夺大船一只，又于海门东、西机与余千等冲敌，杀死伊兵一十八人，拏获千等一十一人；复抢大船一只，历韭山、牛栏矶、南麂、白犬澳等处抢掳渔户，往来劫掠。适遇飓所击，搭寮修〈舟华〉，遂为我兵擒获。是役也，镇臣提衡于水，道臣运策于中；司府馆州诸臣协赞其谋，路标寨游将领毕效其力。至于捐资募士、选锐冲锋，则署分巡道之劳绩独先；设谋制胜、料敌出奇，则水标参将之全功最着』。奏至，俱下所司。
（九月丙戌），浙江巡抚刘一焜题宁区五爪湖外洋、坛头外洋、台区稻杆外洋、渔山下洋等处倭船突犯被官军擒斩功次，总兵王良相等、道府杨一葵等应分别叙录。章下兵部。
（十月庚戌），朝鲜国王李珲因本年正月对马岛主平义成差倭橘智正赍日本国王源秀忠书——欲迎信使以通邻好及刷还朝鲜被虏人，具疏以闻；言『自往年以来，对马岛主平义智等节次来款；以承受家康指教，要请通好为言。该曹及边臣辄以海上大小事情例该逐一具报天朝，今此信使一款尤难轻议，用是推诿累年。兹者忠秀承藉家康余烈，必欲邀得本国信使，乃以此事专责于马岛；而平义成以乳臭小儿嗣袭岛主之任，惟恐所干不成，获罪于日本。今若一意撝斥，终示见绝；则彼乃无聊，转成雠恨。又萨摩州被虏人三万七百余名善习鸟铳、枪刀之势，皆愿刷还；数年之间，请使日急。概其本情，似是借重夸诩；而其间狡猾，抑或难测耳』。总督薛三才亦称：『被虏三万七百余名——习鸟铳、枪刀之势皆愿刷还，此朝鲜之利而非日本之利明甚。倭奴肯一一送还否？安知不以此为通市之饵乎！今既欲因便报答以示羁縻之意，似亦一时权宜；但不宜令其源源而来以窥朝鲜之虚实，复酿曩时平壤之祸胎也』。事下兵部，覆俱如督臣议；言『倭奴谲诈变幻，眈眈未已；其不以一信使往来之故，遂坚睦邻之约而寝启疆之谋明矣。据议遣使报答修好之名似难峻绝，要挟之意尤难信凭。朝廷轸恤藩方，计难遥度于海外；亦惟申儆该国斟酌机宜，自画长便』。上是之。
（万历四十六年五月戊戌），初，四月间有倭船一艘在浙稻秆亭外杀伤民兵，哨官陆大忠、季时衡率各哨攻之，夺其一船，倭始遁去。既而福建参将俞咨皋亦差船截击，遂火其船，倭死无数。于是浙江御史乞照例优赏有功官兵并恤亡阵亡军士。从之。
（八月壬午），朝鲜国王李珲发还漂海人丁。时福建商民薛万春等四十一人浮海商贩，于七月十九日在福建沙埕洋中遇风，以七月二十七日晡漂至朝鲜。国王资给遣还，具本奏知。上命解发福建巡抚衙门审无通贩情弊，即便省发。
（九月丙戌朔），兵部题：『朝鲜国釜山镇水军佥节制使吴大男呈：「去年十二月间本国差役自日本同马岛倭子橘智正带刷还被虏人口三百二十一名回来，说日本国王源秀忠承藉其父家康余业，欲得本国信使；及言剿杀秀赖，为小邦灭雠等情。拒之，恐成雠恨，因依前差送员役之例报答。随据回役称：会同橘倭前到马岛，（岛）主平义成等备船引路，渡三大海，见秀忠。因探得乙卯五月家康率兵三十万攻秀赖于大坂，秀赖兵败，入保内城；家康凿地通道，从中放火，秀赖及将士烧死无数。是后尽以所亲分据要地，易置诸将。及倭来京之时，自提关东兵十余万据住伏见城池，而又令六十六州倭将领所部来会。但秀忠怀疑虑，诸将亦不自安，尚未定关白位号。并将见闻申奏」。该部议：朝鲜与倭仅隔一水，律以「与国」之谊，释旧怨而修新好，岂非至计。但倭奴诡谲叵测，当秀赖新灭、位号未定，频请信使以相夸诩；若其往来频数，乘我不备，俱未可知。兹据该国疏称遣使报答，彼国欢顺；但被虏原称三万七百余名，今刷还者才三百二十一名，即此便见倭好难凭，所探事情果否是的？
但已通好，势难拒绝；惟是外示羁縻、内严备御，则该国君臣事耳。况迩来该国协力讨贼，内或空虚；安知倭不旁睨而生心！
合候命下移咨该国：务要愈加堤防，毋使岛夷通使频烦，得窥虚实；亦毋任奴酋潜通声息，至为响应：庶氛祲消而箕封可固』。从之。
（万历四十七年五月戊戌），福建漳州奸民李新——僭号弘武老及海寇袁八老等率其党千余人流劫焚毁，势甚猖獗；巡抚王士昌檄副将纪元宪、沈有容等率官兵讨平之。
（万历四十八年四月戊辰），巡抚福建王士昌举中路参将张嘉策剿寇有功，以地方保留，奏乞加衔久任。部覆，上从之。
（辛未），巡按广东王命璇奏：『粤海逋寇许彬老、锺大番、余三老等系袁进余党，出没海岛，啸聚剽掠，跳梁于白沙、虎门、广海、莲头之间，商民受其荼毒；业经督臣申饬兵将侦捕于海之东西。其擒贼有功及碣石失利官员，应叙赉、罚治有差』。下兵部。
