四月，之嘉兴，晤徐司寇宝摩石麒。五月，返杭，晤熊行人鱼山开元；感慨时事，呜咽而别。六月，徒步二百里至刘先生家。时越城已降，先生避居杨塴，公遂自绕门山支径入杨塴。先生卧匡床，手挥羽扇，勺水不进者已二十日矣。公不敢哭，泪痕承睫，自序其来；先生颔之，公复徒步而返。奉太夫人避居中村。大兵东渡，郡邑望风迎附。闰六月，我邑前吏科给事中熊公雨殷、九江道佥事孙公硕肤嘉绩以一旅之师，画江而守；公与仲、叔两弟纠合黄竹浦子弟数百人，步迎监国鲁王于蒿坝，驻军江上，人呼之曰世忠营。十月十日，甬上陆行人文虎访公，因相与叹息浙东之事（明年讣音亦值是日）。十一月，马士英窜入方国安营，欲朝见。群臣言士英当诛，熊公恐其挟国安为患也，曰：此非杀士英时，宜使其立功自赎耳。公曰：诸臣力不能杀耳；春秋之孔子，岂能加于陈恒？但不得谓其不当杀也。熊公谢焉。十二月，兵部主事摄余姚县事王正中（之仁从子）表进公所作监国鲁元年大统历；有诏优答，宣付史臣，颁之浙东（小腆纪年隶九月，今从行朝录）。公遗书总兵王之仁曰：公等不从赭山进师，而日于江上放船鸣鼓，攻其有备。蕞尔三府以供十万之众，北兵即不发一矢，一年之后亦何能支？又曰：崇明，江海之门户，盍以兵扰之，亦足分江上之势？闻者皆是公言，而不能用。官兵屯西石山忠端公祠，抽屋材为营火，有司无所致祭；公方驰驱王事，闻之泫然。
三年（丙戌），公三十七岁。
二月，监国以公为兵部职方司主事；公请援李泌客从例，以布衣参军，不许。寻以柯公夏卿与孙公交荐，改监察御史，仍兼职方。张国柱劫王鸣谦由安海入内地，纵兵大掠，诸营大振；廷议欲封以伯。公曰：如此则益横矣，何以待后？请署为将军。监国从之。陈总兵梧败于檇李，渡海至姚，虏掠乡聚；王职方正中方行县事，遣兵击之，乡聚犄角，杀梧。行朝忌正中者，以此声讨。公谓：梧之见杀，犯众怒也。正中为国保民，不当罪。上疏救之，乃止。公力陈西渡之策，熊公再以所部西行，攻下海盐，军弱不能前进而返。五月，孙公嘉绩以所部火攻营卒尽付公，公与王正中合军得三千人，遂偕太仆寺卿陈潜夫、职方查继佐渡海，札潭山；适尚宝司卿朱大定、兵部主事吴乃武皆从浙西来会师，将由海宁取海盐。百里之内，牛酒日至。整军抵乍浦，约崇德义士孙奭等为内应；会大兵已纂严，不得前。六月朔日，浙河兵溃，监国由海道至闽。公归入四明山，余兵愿从者五百人，结寨自固（公有四明山寨记）。公驻军杖锡寺，微服潜出，欲访监国消息，为扈从计。山民畏祸，突焚其寨，部将茅瀚（字飞卿，归安人）、汪涵（字叔度，梅溪人）死之。公归而迹捕之檄累下，奉太夫人徙居化安山丙舍（次年返故居）。慈水刘瑞当先生至，唁慰凭吊，悲啸震空谷。
四年（丁亥），公三十八岁。
居山中，甘露降。注授时历；王侍御仲撝自郡城来，受之而去（公在穷岛空山，古松流水间布算簌簌，自谓屠龙之技，无可与语者。所着有春秋日食历、授时历故、大统历推法、授时历假如、回回历假如、公历假如、气运算法、勾股图说、开方命算、测圆要义诸书，在此数年中）。
五年（戊子），公三十九岁。
刘瑞当先生访公于竹浦，信宿而去。十月辛丑（十日），季弟司舆公卒（公有志，年二十有七）。
六年（己丑），公四十岁。
监国还至海上，公赴行朝，晋左佥都御史，再晋左副都御史。六月，定西侯张名振由南田复健跳所。七月壬戌，公与大学士沈公宸荃、刘公沂春、尚书吴公钟峦、李公向中、侍郎孙公延龄、右佥都御史张公煌言扈监国次健跳所。壬午，北师围健跳；荡胡伯阮进救，却之。王翊却北师，发使贡方物于监国；张名振以表贡不由己达，颇忮之。公上言：诸营文则称侍郎、都御史，武则称将军、都督，惟翊乃心王室，不自张大，而兵又最强；宜优其爵，使之总临诸营，以捍海上。监国乃授翊右佥都御史。明年，晋翊兵部右侍郎。时国事尽归定西侯，即阁臣张公肯堂亦不得有所豫。诸帅之悍，甚于方、王；文臣稍异同其间，立致祸。公既失兵，日与吴尚书霞舟钟峦正襟讲学；暇则注授时、泰西、回回三历。已而，中朝以胜国遗臣不顺命者，令有司录家口上闻。公闻而叹曰：主上以忠臣之后仗我，我所以栖栖不忍去也。今方寸已乱，不能为姜伯约矣。乃陈情监国，得请间行归家。吴公驾三板船，送之二十里外，呜咽涛中。八月，四十初度；有句云：先公殉国余三载（忠端公殉难，时四十三岁），孔子悬弧易一辰（公禄命与至圣只换一时）。是年所作诗，名「穷岛集」。山中乱，奉太夫人徙居邑城（明年返故居）。十月，监国由健跳至舟山，复召公偕冯侍郎跻仲京第副澄波将军阮美乞师日本，抵长崎，不得请。公为赋式微之章，以感将士（是冯公第二次乞师事）；有日本乞师纪、海外恸哭纪（案全氏祖望曰：公日本乞师纪，但载冯公奉使始末，而于己无与。惟避地赋有曰：历长崎与萨斯玛兮，方粉饰夫隆平；又曰：返余旆而西行兮，胡为乎泥中。则是公尝偕冯以行，而后讳之。又案神道碑所载有赣州失事纪、绍武争立纪、舟山兴废、沙定洲纪乱、赐姓本末各一卷，皆此数年间所纪。后合隆武、鲁监国、永历纪年为行朝录。又有汰存录一卷）。
七年（庚寅），公四十一岁。
时，大帅治浙东，凡得名籍与海上有连者，即行名捕。公弟晦木公以参冯侍郎军事被获，待死牢户中；公潜至甬，与万履安、高旦中、冯济道诸公以计活之（详见鲒埼亭集鹧鸪先生神道表）。三月，公至常熟，馆钱氏绛云楼下，因得尽翻其书籍。返至崇德，访孙子度方，欲与之剧谈；而陆丽京闻公至，强之入城，同宿吴子虎家。公有句云：桑间隐迹怀孙爽，药笼偷生忆陆圻。熊公夫人将逮入京，公为调护而脱之。冬，自西园移居柳下；故次庚寅至乙未之诗为「老柳集」，犹昔人之伤心于枯树也（宅前向有老柳，为大风拔去三株，仅存其一；故云）。外舅叶六桐先生迁葬邑东西黄浦，公送葬。
八年（辛卯），公四十二岁。
住柳下，王侍御仲撝来访。夏秋之交，遣间使入海告警。九月丙子（二日），大兵下翁洲（即舟山）；城陷，监国再入闽。是年，季子寿生。
九年（壬辰），公四十三岁。
着律吕新义；王仲撝侍御来，受之而去。
十年（癸巳），公四十四岁。
五月，华亭申山人自然浦南从汴梁苏氏来访，梅雨连绵。苏氏述其昨梦，有裨旧史；山人间戏为江湖相士，膏唇调笑，以破寂寞。太夫人六旬寿辰，甬上万履安先生以所作正气堂寿燕序来祝，阳羡陈少保于庭、定生贞慧父子，皆有诗为寿。
十一年（甲午），公四十五岁。
元夕，悼周侍者。定西侯间使至，被执于天台；公于是又招名捕。冬，送女至甬东朱氏（公第三女，适诸生朱沆），寓万氏寒松斋，与董次公守谕、高旦中斗魁两先生话旧。董以草庐易纂言为问，公即疏其卦下之义以答之。冯行人恺章乞中丞留仙公神道碑铭。
十二年（乙未），公四十六岁。
从化安山至门士魏己任思澄故居，怆然有赋。除夕，季子寿殇；公最钟爱，集中有圹志。故括丙申年之诗，为「杏殇集」。
十三年（丙申），公四十七岁。
二月朔，山烧将及禁茔，夜同泽望公入化安山。三月，墓祭戴家山，公与弟晦木、泽望、孝先三公均为山贼所缚；沈、李二君救之，乃得放归。因避乱入城，寓外家。四月，次子妇孙孺人卒于寓。五月，一孙以痘殇。公诗云：八口旅人将去半，十年乱世尚无央。纪其事也。旋返故居而屋崩，继而粮绝；太夫人徙半霖，秋返故居。慈水寨主沉尔绪祸作，公遭名捕，脱死毫厘间；仲弟晦木公被补，公顿足曰：死矣。赖故人朱湛、侯雅淳（其子诸生林，公之长婿也）、诸雅六救之，得免。
十四年（丁酉），公四十八岁。
春，甬上高旦中过访。花朝前，宿石井，作诗志慨（去年为山兵缚至此地）。
登萝壁山碧霞元君祠。公为仲子直方公就婚上虞虞氏，即馆于其家。上虞之名山，为金罍、萝岩、凤鸣，其遗民为颜叙伯、陆苞甫、范裒生，公于是得与往来游览，欢然道古。至杭，访汪孝廉魏美沨，即寓孤山，讲龙溪调息之法；各赋三诗契勘。
十五年（戊戌），公四十九岁。
同泽望公之郡城，过满听轩，吊倪鸿宝先生；登柳桥，吊王元趾先生。之杭，寓昭庆寺。吴门邹文江来访，始得沉征君眉生消息，因作诗寄之（时眉生已返故园）。集丁酉、戊戌两年诗，名「金罂集」。
十六年（己亥），公五十岁。
二月，之杭孤山；访注孝廉云居，访仁庵师。海上乱，防海之师望门而食；故居苦于蹂躏，乃移居剡中（即化安山）。有山居杂咏诗；公谓读之横身苦楚、淋漓满纸者也。晦木公奉太夫人寓三溪口，公间日往来定省（明年冬，返故居）。哭沉昆铜有句云：传死传生经二载，果然烈火燎黄琮。
十七年庚子，公五十一岁。
居龙虎山堂（四明北麓有化安山，故宋所谓剡中也。东峰状类虎、西峰状类龙，公丙舍适当其间，因名曰龙虎山堂）。八月甲午（十一日），为匡庐之游。过萧山，访徐徽之，不遇。渡钱塘，天章寺晤高旦中。九月丙寅（十四日），抵南康。
辛未，入山；拜李忠毅公祠，宿开先寺，与严羽仪夜坐。游万杉寺，访白鹿洞、经净妙寺，历凌霄岩，登五老峰绝顶；下万松坪，遇徐州阎古古尔梅，限韵赋诗大林寺。寻虞永兴碑，归宗寺、辨真净元社，至玉川门，与雁川夜话，即柬方密之（检讨方以智。时已为僧，改名宏智，字无可）。十月丁亥（五日），返南康。庚子，舟发五老峰下，犹上云龙寺、探雨花洞，遂之金陵。复买舟至崇德，适高旦中、泽望公在城中，入宿其寓。十一月己巳（十八日），发崇德。丁丑，返姚江。有匡庐行脚诗、匡庐游录。
十八年（辛丑），公五十二岁。
仍居龙虎山堂，着易学象数论（钞入四库全书，新安门士校梓）。元夕，甬上门士万允诚斯祯、季野斯同、贞一言访公山中。春暮，之甬上，寓高氏小楼；与辰四斗权、旦中斗魁昆仲赋诗话旧。王侍御仲撝来，公授以天官壬遁之学。公方着纬书三史，仲撝欲居剡共学。常熟邓孝廉起西大临（时已为道士）自甬返，过访，倡和旬日；公与之偕至武林。岁尽，避盗出龙虎山，权寓故居。
康熙元年（壬寅），公五十三岁。
元夕，甬上万子贞一来访。越数日，郡中刘百绳先生汋（忠正公子）来访。二月壬子（八日），龙虎山堂灾。五月乙亥（三日），故居又灾。公诗所云：「半生滨十死，两火际一年」是也。九月，徙住蓝溪市（即陆家埠）。约是年诗为「露车集」，志不安处也。着明夷待访录（次年冬削笔，二老阁校梓。公又着有留书一卷）。
二年（癸卯），公五十四岁。
四月，至语溪。馆于吕氏梅花阁，有水生草堂唱和诗。吴孟举之振暨犹子自牧读书水生草堂，与公联床分檠，共选宋诗钞。踰月，以弟泽望公报病，驰归。八月癸卯（八日），泽望公卒（详公所作圹志）。太夫人七十寿庆，公有句云：白首有儿仍向学，浙河此母尚安全。是年诗名「心断集」，用盂襄阳「心断脊鸰原」之句也。刘伯绳先生问律吕，公以书答之。
三年（甲辰），公五十五岁。
二月，同弟晦木公偕高旦中之语溪。四月杪，益以吕用晦、吴孟举，同至常熟；适虞山病革，一见即以丧事相托。公未之答；虞山言顾盐台求文三篇（一庄子注序、一顾云华封翁墓志、一云华诗序），润笔千金，使人代草，不合我意，知非兄不可。即导公入室，反锁于外；公急欲出，二鼓而毕。虞山叩首称谢。邓起西以精舍馆公，款对数人，张雪崖、顾石宾皆起西之道侣也。寻与顾公子玉书麟生（裕愍公子），访李肤公逊之（忠毅公子）于赤峰、访熊渔山开元于乌目（时熊受法于灵岩继公）。返棹，起西送公于城西杨忠烈祠下，涕泗而别。吴门，访周子佩茂兰（忠介公子）兄弟，即主于其家。越数日，同弟晦木公暨高旦中上灵岩，宏继起储，集文荪符秉（文肃公子）、徐昭法枋、周子洁、邹文江、王双白于天山堂，中有文数篇，昭法见之，嗟赏不已，谓此真震川也；继起遂乞公作三峰第二碑。公约文江同访沉眉生；文江失约，公亦怅然而止。返杭，寓湖上，遇申山人自然于南屏；公问其癸巳同来之客，霜霰将尽，相视唏嘘。净慈奯堂为公烧猪沽酒，痛饮而归。六月，返里。甬上门士万公择斯选过谒，见公诗稿零落，许写净本；公因汰其三之二，取苏文忠行记之意，曰「南雷诗历」。是年诗，系之「吴艇集」。问刘伯绳先生病，留郡城半月。十月初，复之语溪。十二月初。旋里。
四年（乙巳），公五十六岁。
