上帝弃国修行，亦如 释迦，舍梵王太子不居，而于雪山修道。雪山香岩，同一取其洁净也。然上帝修行，何以每劫，皆云『八百』？ 吾试言之：初八百劫舍国，所以明八背舍，释门六度，亦以布施为先；次八百劫，明转八识为大圆镜智，盖欲修道，非智慧无由入也；再八百劫，所以表八正道，即六度万行，皆道之极正；后八百劫，舍己血肉，所以表八解脱。盖前之修行，尚执有人法，至舍己血肉，则人法两忘，故三千二百劫而证金仙。然昔 释迦成佛，经亿万劫，岂上帝止三千二百劫乎！盖『三千』者，所以表超出三界，了达三乘；『二百』者，二谛圆通也，此正成佛之因。故果如其因，佛号大觉，又曰『法王』，而上帝亦称 『觉王如来』，但悲心广大，退佛不居，修菩萨行。又经亿劫，始证玉帝，其功德力，不可思议！
而玉女清净之身，亦与 帝同，何也？盖一阴一阳，同谓之道。玉女修诸妙行，修此道也；上帝普放神光，明此道也。所以玉女身出微妙解脱之香，六道众生，普沾胜利。昔 舍利弗疑龙女成佛，谓女身垢秽，尤有五障，而得成佛，此正色相未忘！盖大道不分男女，不可以色见音声求也。然玉帝放光，遍照无极世界，而金仙菩萨，亦皆飞香散花而至，所以明仙佛同源，无二理也！昔 释迦说法，放光动地，诸天上帝，咸皆云集，亦复如是。然上帝有无量光明，而止名十七光，何也？盖自古佛仙修道，先发慈悲喜舍、四无量心，而后至于圣神功化之极。故帝之十七光，始于大慈悲光，而终之于无能胜光也。然此光明众生中亦非尽无，特人有之，而自蔽之；圣哲有之，而或未至其极；惟上帝全之，为极大耳。至高虚清明天主，乃九天生神之第八天，岂有不知玉帝之事？而 元始天尊，犹谓汝等，尚以结习，不睹是帝慈颜，盖为众生结习障重，不能见性，故假训天主之词，以教世人断障耳！断障之要，莫先于发大悲心，惟悲心方能度世，故菩萨于一切众生，皆思以无余盘而灭度之。
凡疑惑是非，人我贪瞋，骄慢淫欲，种种诸障，皆生死轮回根本。经曰『断障』，即佛谓『度生』，儒谓『克己』。修持之法，以是为先，若持是经，人能断障以祛其私，冥心以守其正，不骄不诈，尽忠全孝，皈奉至道，斯谓之『正一真人』。非谓口头读诵，而即可自命真人。
尔在会诸子，恒诵此经，若于经内所说诸障，一一能除断之，以求至于无障可断，斯为体道之极功，入圣超凡之至要也！」
诠释经义章第二十九
「佛仙两门，教典各殊，其修持亦多各异。然 予观《玉经》旨趣，多与释经相同，如经称『十方化身 玉帝，普皆来集 元始会下，如无边明镜。』此与 释迦分身十方，至欲开多宝佛塔，则三变净土，容受十方，分身诸佛，同开宝塔同也；『清明天主，所献天宝奇花，旋结成盖』，与『毘耶离，五百长者子，各持七宝盖，用以献 佛，佛令诸宝盖，合成一盖』同也。盖一而不分，无以见万化之神；分而不一，无以见一元之妙。至于 释迦应身，降自种民天宫。按诸道藏，释迦亦即玉帝化身，特全藏人未之见，故弗知耳！所以示迹受生，与修证之神化，大略相同。所不同者，惟五方诰命。盖上帝布化行政，宁谧水土之事，与 佛不同，然五方诰命，与赤书灵文，元始天尊，谓其生于浩劫之先，混沌之初，二仪待之以分，日月待之以明。试思两仪未判，日月未明，此灵文生于何处？于此悟得，方称透彻。然人知 五老上帝，叩请 元始，开《玉匮》科，传《灵宝》法，而不知经称五老，所以显人禀五行之，皆归于元。
《玉匮》灵文，载人心性之内，孰谓《玉经》止谈上帝本行之事，而非阐道之书乎！凡修持之士，能依经先断诸障，后依《五方灵文》如法行持，持之既久，自有天真护持，群魔束形，十二身可以自证三十种功德，不求而自至矣！特患人妄缘不除，尘障未净，若果诸念不生，万缘顿息，则尘沙恶业，随心消散。若但诵读而不能修持，终属有漏之因，非经义也。宁惟《玉经》，凡诵诸经，皆当如是体会。
今时奉道之士，未尝不多，结会诵经，亦未尝少！或礼三元，或奉北斗，或依佛法，或慕伭风，种种不一。然仅知有禳灾度厄之功能，而未达学道希仙之大果，以致诵经者多，明经者少。试再将三元诸旨趣，剖晰言之。即如三元，人知为云台山上，有此三帝君，于都会府中，发号施令。以事迹论之，则台山在北海之中，都会府系三圣出治之所。如此见解，是泥于文辞！三圣训世之心，失之远矣！惟以义求之，则三圣同一太极，不离当人之身。所谓海者，智慧性海也，云台山，亦即云台方寸心地，云即心中发现之慧光也，都会府，亦即此身灵妙之府，泛应曲当之原。子舆氏曰：『万物皆备于我矣，非都会而何？』况上元九，九阳之： 于行为木，于时为春，故上元诞于正月，乘春也；于常为仁，仁主慈爱，故其功用为赐福；于人生神，为胞命元之，中元七，七阳之； 于行为金，于时为秋，故中元诞于七月，乘秋也；于常为义，义主决断，故其功用为赦罪；于人生神，为魂命元之，下元五，五阳之； 于行为水，于时为冬，故下元诞于十月，乘水也；于常为智，智能消障，故其功用为解厄；于人生神，为魄命元之。
夫此三元，在人一身，主应泥丸、丹田、洞房之宫，凡人起一意念，即能知之，以其神明之相通也。得道之士，皆从三元保举，为上帝枢密，职掌善恶报应之臣，权衡修道之士，黜陟群仙，总理诸神，其勋伟，其权重也。然仙经虽传世久远，奉持者多，昔未申明其旨，以致世人莫知。 吾今不惜泄漏，剀切指示，务期人人如法持诵，以我之心，合帝之心，则 三元帝君，随心而应，祈福福至，禳祸祸消。昔法达诵《法华经》，至满三千部，一日参谒 六祖，祖问以经义，达不能对。 祖曰：『汝名法达，未能达法。』祖因开示 佛之知见，达于言下省悟，因呈偈曰：『经诵三千部，曹溪一句亡。』祖曰：『尔前诵经，只是为经所转，未能转经，于兹方可称诵经僧也！』
尔诸在会弟子，及未来一切众生，凡诵诸经，务能转经，勿为经所转，则善矣！」
尊信圣教章第三十
「古人着书立说，以垂训后世，于意有未尽，言不能显者，设为譬喻，以畅厥旨，使人自得于意言之外。佛经云：『诸有智者，要以譬喻得解。』故三教之书，多有取譬。然寓意遥深，人多错会。如《周易》一书，圣人立象以尽意，《系辞》以明吉凶。但其取譬幽深伭远，如： 诫阳极于上，盈不可久，则曰『亢龙有悔』； 其诫阴极于上，至于阳争，则曰『龙战于野』； 其血伭黄，诫持疑不决，则云『载鬼一车』； 诫事不续终，鲜克有济，则云『狐濡其尾』。六十四卦之辞，多属取譬，若非 至圣作为象传，以发明其义。后之儒者，何由而知？
昔文始帝君，瞻紫气自东而西，知有异人。因遇 太上，求着《道德》二篇，阐发秘密之旨，大无不包，小无弗备。然其中所言治国用兵之道，多属喻言，即佛经亦以庄严佛国为清净心地。 太上之言治国，理此身心也；即用兵亦喻战退阴魔，克去私欲之害心者。如《易》曰：『震用代鬼方，三年有赏于大国。』《阴符经》云：『绝利一原，用师十倍；三返昼夜，用师万倍。』同一义耳！至于经中：『将欲翕之，必固张之；将欲弱之，必固强之；将欲废之，必固兴之；将欲夺之，必固与之。』此乃天运之自然，如日将入而返照，岁将寒而忽热，人将死而倏强，灯将灭而复爆，无异理也！然此理人最难知，故谓『微明』。欲人于此种事，豫知祸福之将至，而先审其几焉！世儒不察，以为列国分争之事，纵横捭音摆合之术，不亦缪乎？又云：『和大怨，必有余怨，安以为善？』亦正为狃于小安，而忘远虑者，下一痛棒！与《易》曰：『君子以思患而预防之。』同一切要，若周郑交质于前，而即交恶于后，非明征乎？
世儒以为勾践与吴之事，不知此经之作，在吴越未构怨之前，而以和怨之语，为吴越事误矣！至谓道德之后，流为刑名，而以 太上所著之言，为机械变诈，不尤诬乎？
昔 至圣问礼于 太上，出谓门弟子曰：『 吾观 老子，其犹龙乎？』圣如 至圣，尚以『犹龙』誉之，后之儒者，鄙以见小，岂反愈于 至圣乎？昔叔孙武叔毁 仲尼，端木氏以不知量责之，而世儒之辟 太上，诎道德者，亦祇为不知量耳！究之于 太上，无所损也。然世之注《道德》者，不啻数十家，即罗什法师，才识过人，其注《道德》，犹以其未曾说心而病之，况其余乎？但经中『不见可欲，使心不乱』之语，正戒其妄心，而慎守其真心也。
