三千界內慈悲主 百億洲中大法王 願開蓮目鑒凡情 眾生有求皆感應
一切諸佛。愍念眾生。為說藥師道場懺法。今當歸命。一切諸佛。
南無毗盧遮那佛 南無本師釋迦牟尼佛 南無藥師琉璃光如來 南無無量壽佛 南無盡十方遍法界過去一切諸佛 南無盡十方遍法界現在一切諸佛 南無盡十方遍法界未來一切諸佛 南無藥師琉璃光如來本願功德經 南無日光遍照菩薩 南無月光遍照菩薩 南無文殊師利菩薩 南無觀世音菩薩 南無得大勢菩薩 南無無盡意菩薩 南無寶曇華菩薩 南無藥王菩薩 南無藥上菩薩 南無彌勒菩薩 南無消災障菩薩 南無增福壽菩薩 南無樂音樹下三萬六千菩薩 南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧 南無救脫菩薩
禮諸佛已。次復懺悔。（弟子某）等。普為四恩三有。及法界一切眾生。悉願斷除三障。歸命懺悔。我與眾生。無始來今。由愛見故。內計我人。外因惡友。不隨喜他。一毫之善。惟遍三業。廣作眾罪。事雖不廣。惡心徧布。晝夜相續。無有間斷。覆諱過失。不欲人知不畏惡道。無慙無愧。撥無因果。如斯罪障。未經懺悔。我於今日。對十方佛。藥師如來。深信因果。生重慙愧。生大怖畏。發露懺悔。斷相續心。發菩提心。斷惡修善。勤策三業。翻昔重過。隨喜凡聖。一毫之善。念藥師佛。有大願力。能救拔我。出二死海。置三德岸。惟願慈悲。哀憐攝授。各各志心。歸命頂禮。
南無毗盧遮那佛 南無本師釋迦牟尼佛 南無藥師琉璃光如來 南無無量壽佛 南無盡十方遍法界過去一切諸佛 南無盡十方遍法界現在一切諸佛 南無盡十方遍法界未來一切諸佛 南無藥師琉璃光如來本願功德經 南無日光遍照菩薩 南無月光遍照菩薩 南無文殊師利菩薩 南無觀世音菩薩 南無得大勢菩薩 南無無盡意菩薩 南無寶曇華菩薩 南無藥王菩薩 南無藥上菩薩 南無彌勒菩薩 南無消灾障菩薩 南無增福壽菩薩 南無藥音樹下三萬六千菩薩 南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧 南無救脫菩薩
禮諸佛已。次復懺悔。（弟子某）等。自從無始以來。至於今日。所有貪瞋嫉妬之病。憍慢自傲之病不識善惡之病不信罪福之病不孝五逆之病。破辱三寶之病。不修齋戒之病。破犯尸羅之病。自讚毀他之病。貪得無厭之病。迷聲逐色之病。貪香愛觸之病。信邪倒見之病。躭婬嗜酒。放逸無度之病。設復遇醫。授與非藥之病。及無餘量災難陵辱。悲愁煎逼。身心受苦之病。欲令是等病苦消除。所求願滿。爾時藥師琉璃光如來入三摩地。名曰。除滅一切眾生苦惱。既入定已。於肉髻中。出大光明。光中演說大陀羅尼曰。
南無。薄伽伐帝。[鞥-合+（白-日+田）]殺社。窶嚕薜琉璃。鉢囉婆。喝喇闍也。怛他揭哆耶。阿囉訶帝。三藐三勃陀野。怛姪他。唵。[鞥-合+（白-日+田）]殺逝。[鞥-合+（白-日+田）]殺逝。[鞥-合+（白-日+田）]殺社。三沒揭帝莎訶
爾時光中說此呪已。大地震動。放大光明。一切眾生。病苦皆除。受安隱樂。是知懺悔之功。諸病心瘳之靈。劑。了生脫死之奇方有。
大醫王。應病設藥。所謂慈悲喜捨是藥。忍辱柔和是藥。正信三寶是藥。勤修福慧是藥。六波羅蜜是藥。飽飡甘露是藥。貪求法味是藥。修真養氣是藥。返本還元是藥。有過能改是藥。善巧方便是藥。不動聲色是藥。清心斷慾是藥。常用如是等藥擣篩和合。時取服之。眾生若病。應同一病。眾生須藥。應同一藥。若說多法。是名顛倒若據一乘實相而言。則何增何減。何垢何淨。何善何惡。何罪何福。何病何藥。觀昔方便。如夢中人。夢身患病。求醫服藥。而得除愈。及其夢醒。則悟本來無病。無病亦無。而況醫藥。故眾生之病。同一幻病。如來之藥。同一幻藥。故知如來說法。一相一味。所謂解脫相。離相。滅相。究竟涅槃。終歸於空。如一雲所雨。而藥樹大小。各得滋茂。我等今者。蒙佛恩力。得聞。
世尊藥師琉璃光如來名號。不復更有病苦之難。乃能究竟無上菩提。是故今日。我等相率。皆同一心乃至盡形歸佛法僧。今當歸命一切諸佛。
南無毗盧遮那佛 南無本師釋迦牟尼佛 南無藥師琉璃光如來 南無無量壽佛 南無盡十方遍法界過去一切諸佛 南無盡十方遍法界現在一切諸佛 南無盡十方遍法界未來一切諸佛 南無藥師琉璃光如來本願功德經 南無日光遍照菩薩 南無月光遍照菩薩 南無文殊師利菩薩 南無觀世音菩薩 南無得大勢菩薩 南無無盡意菩薩 南無寶曇華菩薩 南無藥王菩薩 南無藥上菩薩 南無彌勒菩薩 南無消灾障菩薩 南無增福壽菩薩 南無樂音樹下三萬六千菩薩 南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧 南無救脫菩薩
禮諸佛已。次復懺悔。若有眾生。欲脫病苦。當為其人七日七夜受持八關齋戒。應以飲食。及餘資具。隨力所辦。供養苾蒭僧。晝夜六時。禮拜行道。供養彼世尊。藥師琉璃光如來。讀誦尊經四十九遍。燃四十九燈。乃至四十九日。光明不絕。可得過度危厄之難。不為諸橫惡鬼所持。是故今日。與現前眾等。各各翹懃。燒香散華。燃燈造旛。放生修福。令度苦厄。不遭眾難惟願如來。證明懺悔。（某）等又復無始以來。至於今日。凡有所為。皆不稱意。當知悉是過去已來。惡業遺報所致。是故今當勤求懺悔。懺悔人間惡夢惡相諸不吉祥之報。懺悔人間惡病。連年累月不瘥。枕臥牀席。不能起居之報。懺悔人間冬瘟夏疫。毒癘傷寒之報。懺悔人間水火盜賊。刀兵危險之報。懺悔人間為被獅子虎狼毒蛇惡蝎蜈蚣蚰蜒。害人之報。懺悔人間生老病死。憂愁苦惱之報。懺悔眾生身語意業。造作增長種種惡業之報。懺悔眾生當墮三惡趣中。無量千歲受諸劇苦之報。懺悔眾生應以地獄傍生鬼趣。流轉無窮之報。懺悔眾生不復更生諸餘惡趣之報。懺悔眾生為人奴婢。受他驅役之報。懺悔眾生或作牛馬駝驢。恒被鞭撻之報又常負重隨路而行。飢渴逼惱之報。懺悔人間厭魅蠱毒。飛屍邪鬼。偽作妖異之報。如是現在未來人天之中。無量禍橫。災疫死難衰惱之報。（眾等）今日至誠向藥師佛。海會聖眾。求哀懺悔。願皆消滅。前已究竟。是病是藥。同歸一幻。惡業所致。一切報障。今當次第。發願回向。（某）等願以此懺悔三障所生功德。悉皆回向。施與一切眾生。俱同懺悔。願與一切眾生。從今以去。乃至菩提。念生死苦。發菩提心。改惡修善。返邪歸正。身心安樂。妙算無窮。衣食豐饒。家屬資具。倉庫盈溢。形相端正。聰明智慧。勇健威猛。諸將擁護。佛聖匡扶。凡所施為。悉希。
慈蔭。弟子（某）等。又願從今以去。速證菩提。相好光明。莊嚴殊勝。願諸眾生。蒙光開曉。隨意所趣。作諸事業。願諸眾生皆得無盡。所受用物。無所乏少。願諸眾生建立大乘。悉令安住菩提道中。願諸眾生得不缺戒。設有毀犯。還得清淨。願諸眾生端正黜慧。諸根完具。無諸疾苦。願諸眾生眾病悉除。家屬資具。悉皆豐足。願諸眾生轉女成男。具丈夫相。乃至菩提。願諸眾生出魔羅網。解脫一切外道纏縛。願諸眾生王法所加。悲愁煎逼。皆得解脫。願諸眾生飲食飽足。後以法味。畢竟安樂。願諸眾生如其所好。種種衣服。隨心滿足。願諸眾生長壽富饒。官位男女。凡有所求。一切皆遂。令諸世界。百怪九橫。八難三災。他國侵擾。盜賊反亂。一切惡難。盡皆消滅。國界安隱。風雨順時。穀稼成熟。一切有情。無病歡樂。菩提行願。念念增明。救苦眾生。常如己想。又願生生世世。在在處處。不墮邊鄙。生正信家。相貌端嚴。智慧辯才。遠離惡法。親近善友。堅持律行。安立大乘。又願生生世世。在在處處。興顯佛法。破諸魔網。奮志滿修六波羅蜜。廣修供養。福慧莊嚴。忍辱精進。證菩提道。我等今日。應當念報。
藥師琉璃光如來恩德。常應如是利益安樂一切有情。是故志心。歸命頂禮。
南無薄伽伐帝。[鞥-合+（白-日+田）]殺社。窶嚕薜琉璃。鉢囉婆。喝喇闍也。怛他揭哆耶。阿囉訶帝。三藐三勃陀野。怛姪他。唵。[鞥-合+（白-日+田）]殺逝。[鞥-合+（白-日+田）]殺逝。[鞥-合+（白-日+田）]殺社。三沒揭帝莎訶
東方端坐。無上醫王。十二大願妙難量。滅罪殄災殃。降福垂祥。增益壽綿長。
藥師佛 藥師佛 消災延壽藥師佛 南無消災延壽藥師佛
（如前起佛偈遶壇念佛迴向）
